165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4362 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  65.05 
 
 		 184 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  70.62 
 
 		 183 aa  229  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  69.23 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  64.16 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  70.81 
 
 		 184 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  70.51 
 
 		 202 aa  217  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  62.15 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  69.23 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  69.23 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  70 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  68.99 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  69.87 
 
 		 187 aa  211  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  68.75 
 
 		 195 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  69.62 
 
 		 193 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  58.25 
 
 		 183 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  66.46 
 
 		 186 aa  207  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  66.04 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  67.07 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  65.62 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  60.67 
 
 		 184 aa  198  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  54.36 
 
 		 189 aa  197  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  65.81 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  62.5 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  66.03 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  63.23 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  56.83 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  52.06 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  58.13 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  56.41 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  51.66 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  45.18 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  48.54 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  47.95 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  46.58 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  50.65 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  48.57 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  47.95 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  48.99 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  50.34 
 
 		 156 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  49.66 
 
 		 156 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  36.94 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  48.98 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  49.66 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  48.98 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  47.62 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  48.28 
 
 		 134 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.59 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.14 
 
 		 220 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  47.26 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  48.97 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.94 
 
 		 558 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  43.07 
 
 		 354 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.28 
 
 		 141 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  47.62 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  38.66 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  48.32 
 
 		 190 aa  111  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  44.58 
 
 		 167 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.9 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  44.22 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  46.9 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  41.5 
 
 		 279 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  43.06 
 
 		 133 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  44.44 
 
 		 133 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.31 
 
 		 308 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 		 184 aa  104  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  45.86 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.97 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  47.14 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.46 
 
 		 261 aa  98.2  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  46.62 
 
 		 160 aa  98.2  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  39.58 
 
 		 133 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  40.61 
 
 		 161 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  39.58 
 
 		 133 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  44.2 
 
 		 142 aa  96.3  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  44.37 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  39.61 
 
 		 222 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  45.52 
 
 		 157 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  43.18 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  39.58 
 
 		 151 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  48.28 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.31 
 
 		 139 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 		 163 aa  88.2  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  39.1 
 
 		 134 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  40.71 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  38.67 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  38.99 
 
 		 596 aa  85.5  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 		 133 aa  84.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  35.17 
 
 		 134 aa  84.3  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  42.07 
 
 		 611 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  40.6 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  39.06 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  35.17 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  40.69 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  37.58 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>