More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4319 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 389 aa  780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 389 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  80.98 
 
 		 388 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  70.83 
 
 		 402 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  65.89 
 
 		 388 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  65.89 
 
 		 388 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  62.63 
 
 		 385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.62 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  60.52 
 
 		 385 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.08 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  61.34 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  61.6 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  61.6 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 		 385 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  58.25 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.51 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  60.31 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.28 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  60.31 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.82 
 
 		 380 aa  363  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.86 
 
 		 386 aa  359  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.14 
 
 		 393 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.22 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.96 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  51.57 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.82 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.3 
 
 		 387 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 		 405 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.75 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.89 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.6 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.65 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.53 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.13 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0174  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 386 aa  209  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.66 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 		 384 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.26 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.83 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  35.31 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.7 
 
 		 384 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.96 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.78 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.05 
 
 		 378 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  37.47 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.22 
 
 		 390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0308  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.51 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.783951  normal  0.165329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.91 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02267  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.85 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  37.5 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.24 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6437  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.08 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 		 383 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2653  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  37 
 
 		 382 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 		 384 aa  189  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  36.22 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.47 
 
 		 376 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.76 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>