More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4250 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  95.81 
 
 		 450 aa  843    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  80.97 
 
 		 447 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  85.78 
 
 		 440 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  100 
 
 		 451 aa  907    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  79.58 
 
 		 447 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  79.81 
 
 		 447 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  79.35 
 
 		 446 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  100 
 
 		 451 aa  907    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  80.74 
 
 		 469 aa  718    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  86.95 
 
 		 438 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  79.35 
 
 		 450 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  79.58 
 
 		 447 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  80.28 
 
 		 454 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  73.06 
 
 		 438 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  79.35 
 
 		 450 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  79.41 
 
 		 469 aa  722    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  79.35 
 
 		 450 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  79.58 
 
 		 447 aa  712    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  80.74 
 
 		 455 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  70.6 
 
 		 440 aa  631  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  63.33 
 
 		 449 aa  554  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  82.86 
 
 		 335 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  82.86 
 
 		 335 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  58 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  58 
 
 		 444 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  49.63 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  48.82 
 
 		 624 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  50.79 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  47.04 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  46.42 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  46.12 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  50.77 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.16 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  47.55 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  45.89 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  48.55 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  50.38 
 
 		 608 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  46.15 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  44.55 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  45.82 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  45.82 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  45.82 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  45.85 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  45.9 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  46.48 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  47 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  44.86 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  45.9 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  46.9 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  46.41 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  44.42 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  45.32 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  44.2 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  44.94 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  44.95 
 
 		 467 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  44.76 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  50.14 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  49.72 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  44.76 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  47.74 
 
 		 408 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  47.33 
 
 		 452 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  47.62 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  44.13 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  49.12 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  50.14 
 
 		 469 aa  363  4e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.91 
 
 		 449 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  49.46 
 
 		 463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  48.56 
 
 		 449 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  47.37 
 
 		 452 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  48.98 
 
 		 418 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  47.01 
 
 		 442 aa  358  9e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  45.64 
 
 		 677 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  49.1 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  48.59 
 
 		 421 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  50.27 
 
 		 418 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  48.84 
 
 		 634 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  45.25 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  45.53 
 
 		 492 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  49.59 
 
 		 449 aa  352  7e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  50.27 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  52.48 
 
 		 563 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  46.73 
 
 		 437 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  45.43 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  46.6 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  49.69 
 
 		 638 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  46.13 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 491 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  44.61 
 
 		 498 aa  346  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  44.12 
 
 		 491 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  49.72 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  46.05 
 
 		 508 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  47.16 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  46.97 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  44.11 
 
 		 572 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  48.21 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  49.09 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  47.15 
 
 		 477 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  51.42 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  48.95 
 
 		 482 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  47.15 
 
 		 484 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>