More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3968 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  59.01 
 
 		 727 aa  832    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  54.46 
 
 		 727 aa  763    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 886 aa  1792    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  59.24 
 
 		 744 aa  796    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  56.22 
 
 		 723 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  59.24 
 
 		 751 aa  869    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  82.52 
 
 		 878 aa  1440    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 886 aa  1792    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  64.35 
 
 		 746 aa  903    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  58.34 
 
 		 748 aa  762    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  60.68 
 
 		 722 aa  851    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  58.7 
 
 		 743 aa  823    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  50.86 
 
 		 871 aa  823    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  57.79 
 
 		 741 aa  833    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  86.96 
 
 		 883 aa  1523    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  58.93 
 
 		 730 aa  827    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  61.54 
 
 		 755 aa  810    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  54.76 
 
 		 723 aa  769    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  54.07 
 
 		 730 aa  775    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  42.84 
 
 		 856 aa  628  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  43.14 
 
 		 856 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  41.87 
 
 		 858 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  40.66 
 
 		 896 aa  603  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  42.04 
 
 		 875 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  43.27 
 
 		 855 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  43.15 
 
 		 865 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  40.48 
 
 		 857 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  42.26 
 
 		 861 aa  588  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  42.26 
 
 		 861 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  41.64 
 
 		 856 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  42.18 
 
 		 856 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  43.38 
 
 		 855 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  43.22 
 
 		 855 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  43.22 
 
 		 855 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  43.15 
 
 		 862 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  41.92 
 
 		 890 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  42.32 
 
 		 861 aa  569  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  36.82 
 
 		 894 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  36.46 
 
 		 876 aa  544  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  38.1 
 
 		 895 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  40.84 
 
 		 879 aa  538  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  39.88 
 
 		 877 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  40 
 
 		 877 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  37.61 
 
 		 906 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  41.22 
 
 		 872 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  40 
 
 		 901 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  40.44 
 
 		 879 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  38.01 
 
 		 902 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  38.77 
 
 		 900 aa  503  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  36.69 
 
 		 894 aa  502  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  37.6 
 
 		 914 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  37.93 
 
 		 908 aa  499  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  38.67 
 
 		 885 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  38.64 
 
 		 918 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  34.73 
 
 		 887 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  33.56 
 
 		 893 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  35.15 
 
 		 882 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  35.46 
 
 		 910 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  36.72 
 
 		 939 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  37.61 
 
 		 881 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  30.27 
 
 		 874 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  30.55 
 
 		 874 aa  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.87 
 
 		 622 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  30.63 
 
 		 637 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.43 
 
 		 636 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.91 
 
 		 664 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.91 
 
 		 647 aa  169  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.33 
 
 		 778 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.44 
 
 		 778 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  28.38 
 
 		 646 aa  162  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  23.99 
 
 		 573 aa  153  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  27.56 
 
 		 1086 aa  147  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.82 
 
 		 755 aa  147  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.29 
 
 		 755 aa  144  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  21.03 
 
 		 741 aa  144  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 1103 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  34.17 
 
 		 579 aa  138  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  31.6 
 
 		 328 aa  138  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  33.75 
 
 		 585 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  34.47 
 
 		 581 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  30.89 
 
 		 538 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.69 
 
 		 757 aa  134  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  33.23 
 
 		 593 aa  132  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.07 
 
 		 594 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  29.34 
 
 		 588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 		 581 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  28.3 
 
 		 584 aa  129  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  33.85 
 
 		 585 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 		 593 aa  128  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.34 
 
 		 754 aa  128  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  33.22 
 
 		 572 aa  127  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  34.69 
 
 		 569 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  32.2 
 
 		 584 aa  125  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  34.16 
 
 		 571 aa  125  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  24.74 
 
 		 560 aa  124  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  32.71 
 
 		 581 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  32.71 
 
 		 581 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  32.4 
 
 		 581 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 582 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  31.03 
 
 		 582 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>