More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3942 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00575  alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit, FAD/NAD(P)-binding  63.34 
 
 		 521 aa  678    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3018  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.34 
 
 		 531 aa  678    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.531369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1243  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.46 
 
 		 517 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4879  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.27 
 
 		 529 aa  707    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2440  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.02 
 
 		 520 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00564  hypothetical protein  63.34 
 
 		 521 aa  678    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3433  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  68.13 
 
 		 533 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3533  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.63 
 
 		 520 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.463079  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0246  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  88.74 
 
 		 524 aa  927    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0118696  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0658  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.34 
 
 		 531 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.81 
 
 		 522 aa  671    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3107  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  70.99 
 
 		 520 aa  735    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00119955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0782  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  66.8 
 
 		 531 aa  683    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0983751  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3656  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  67.89 
 
 		 530 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0756  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  67.7 
 
 		 535 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2368  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  68.47 
 
 		 518 aa  687    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0331686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3573  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.64 
 
 		 520 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2974  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.79 
 
 		 520 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250232  normal  0.0117128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26320  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.53 
 
 		 521 aa  713    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3255  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  69.63 
 
 		 520 aa  721    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  67.12 
 
 		 521 aa  694    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.401893  hitchhiker  0.00190824 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04590  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  68.86 
 
 		 530 aa  686    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0692  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.34 
 
 		 531 aa  678    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.766507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5071  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  68.47 
 
 		 518 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132309 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2044  alkyl hydroperoxide reductase subunit  67.7 
 
 		 622 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3037  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.34 
 
 		 531 aa  678    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2924  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase class-II  71.95 
 
 		 520 aa  746    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0448  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.44 
 
 		 509 aa  638    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.81 
 
 		 535 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1954  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.67 
 
 		 532 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0428675  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.8 
 
 		 521 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.86 
 
 		 518 aa  691    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00897132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0520  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.34 
 
 		 531 aa  678    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2094  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.63 
 
 		 523 aa  731    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3926  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.06 
 
 		 520 aa  655    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1417  thioredoxin-disulfide reductase  68.39 
 
 		 526 aa  708    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1927  alkyl hydroperoxide reductase subunit  66.73 
 
 		 601 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.586969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II, active site  67.57 
 
 		 519 aa  681    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0870  subunit F of alkyl hydroperoxide reductase  66.6 
 
 		 531 aa  680    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.037495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3612  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  67.7 
 
 		 519 aa  714    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2999  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.29 
 
 		 525 aa  680    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.336504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2811  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.96 
 
 		 538 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000304525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.31 
 
 		 518 aa  720    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0640975  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1196  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.34 
 
 		 518 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000420739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3045  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  69.88 
 
 		 523 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0666  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  67.7 
 
 		 535 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1206  AhpF  70.21 
 
 		 530 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0217  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  70.36 
 
 		 521 aa  732    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.99 
 
 		 520 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.663768  normal  0.219895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.67 
 
 		 533 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3186  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.44 
 
 		 520 aa  719    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4496  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  68.86 
 
 		 532 aa  720    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.83 
 
 		 523 aa  683    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0259  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  72.76 
 
 		 527 aa  734    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00384538 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3729  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  63.25 
 
 		 520 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1535  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.14 
 
 		 526 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000673423  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3500  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.02 
 
 		 532 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01720  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  69.6 
 
 		 521 aa  726    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.38 
 
 		 532 aa  726    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0943  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  64.22 
 
 		 509 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4055  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  100 
 
 		 524 aa  1059    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.64 
 
 		 531 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1376  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  67.24 
 
 		 522 aa  689    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1814  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.39 
 
 		 523 aa  717    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3942  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  100 
 
 		 524 aa  1059    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3983  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  69.83 
 
 		 532 aa  731    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170234  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5402  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  70.02 
 
 		 530 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000100097  normal  0.196114 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4090  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.67 
 
 		 533 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4221  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.46 
 
 		 529 aa  715    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.054716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0688  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  67.5 
 
 		 530 aa  700    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242332  normal  0.621191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0627  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  63.34 
 
 		 531 aa  678    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0618  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.57 
 
 		 520 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.309291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1146  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.68 
 
 		 521 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.337025 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1403  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.49 
 
 		 525 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4716  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  59.88 
 
 		 523 aa  631  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0956  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.12 
 
 		 527 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3326  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.32 
 
 		 525 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0848  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.32 
 
 		 528 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3639  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.51 
 
 		 528 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3518  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.51 
 
 		 528 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3223  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.93 
 
 		 525 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.35 
 
 		 521 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3445  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  61.51 
 
 		 528 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0391  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.67 
 
 		 508 aa  628  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0438  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.67 
 
 		 508 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0376  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.67 
 
 		 508 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0439  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.86 
 
 		 508 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.6667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0747  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.11 
 
 		 524 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.501154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0329  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.67 
 
 		 508 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0313  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  62.67 
 
 		 508 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0316  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  62.86 
 
 		 508 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0344  alkyl hydroperoxide reductase subunit F  62.67 
 
 		 508 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4927  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  62.67 
 
 		 508 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0800  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.54 
 
 		 525 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0314  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.09 
 
 		 508 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0167284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.35 
 
 		 523 aa  621  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.23 
 
 		 521 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.599853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0324  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.09 
 
 		 508 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.25 
 
 		 509 aa  615  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2518  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  60.54 
 
 		 509 aa  612  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>