251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3848 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_003296  RS05540  hypothetical protein  82.99 
 
 
199 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00436113  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  42.77 
 
 
892 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  41.85 
 
 
905 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  41.38 
 
 
897 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
812 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  41.18 
 
 
895 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  41.42 
 
 
892 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  42.77 
 
 
900 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  37.06 
 
 
886 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
889 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
810 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627705 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  35.43 
 
 
877 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  39.18 
 
 
904 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4857  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4815  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342854  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  36.72 
 
 
877 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
175 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  36.52 
 
 
517 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.021927  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  41.98 
 
 
899 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  37.89 
 
 
893 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
897 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  35.37 
 
 
920 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  34.52 
 
 
921 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  34.59 
 
 
892 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  38.64 
 
 
918 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 
896 aa  97.8  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
895 aa  97.1  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  39.87 
 
 
821 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
892 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  38.29 
 
 
901 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  38.29 
 
 
908 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
918 aa  95.5  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
901 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
887 aa  95.5  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2948  CoA-binding domain-containing protein  36.08 
 
 
899 aa  94.7  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  36.48 
 
 
880 aa  94.4  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  36.48 
 
 
880 aa  94.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.33 
 
 
929 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
880 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  36.67 
 
 
902 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  33.89 
 
 
888 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.42 
 
 
907 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  36.71 
 
 
881 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  33.94 
 
 
911 aa  91.3  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
882 aa  91.3  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2384  CoA-binding domain-containing protein  37.18 
 
 
887 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.272058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  35.54 
 
 
908 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  34.78 
 
 
976 aa  89.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 
909 aa  89  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
188 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  34.44 
 
 
893 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
899 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
906 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  33.51 
 
 
915 aa  88.2  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  34.15 
 
 
907 aa  87.8  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  34.38 
 
 
894 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  29.83 
 
 
897 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
882 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1932  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
907 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.56977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  35.44 
 
 
926 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
896 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  31.87 
 
 
902 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  35.9 
 
 
894 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  33.52 
 
 
886 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
886 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  34.81 
 
 
911 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  33.52 
 
 
886 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  33.52 
 
 
886 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16050  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  35.03 
 
 
934 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.243356 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
886 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.52 
 
 
886 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.52 
 
 
886 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  33.52 
 
 
886 aa  85.1  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.52 
 
 
886 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  33.52 
 
 
886 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1200  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
867 aa  85.1  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 
900 aa  84.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  34.44 
 
 
903 aa  84.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  35.62 
 
 
886 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  35.62 
 
 
886 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  32.42 
 
 
882 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  35.62 
 
 
886 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  35.62 
 
 
886 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
915 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
898 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  31.35 
 
 
907 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  32.96 
 
 
903 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  35.19 
 
 
887 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.18 
 
 
909 aa  82.4  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 
807 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  31.87 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  30.27 
 
 
907 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  36.31 
 
 
831 aa  81.6  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0252  GCN5-related N-acetyltransferase  32.4 
 
 
882 aa  81.6  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0975681  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
887 aa  81.3  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1694  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
926 aa  81.3  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133796  normal  0.55865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>