More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3845 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 406 aa  782    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 406 aa  782    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  84.9 
 
 		 399 aa  614  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 403 aa  249  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 		 419 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  49.72 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  45.38 
 
 		 412 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 400 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  43.3 
 
 		 429 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  43.04 
 
 		 429 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  44.38 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  44.11 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  44.11 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  44.11 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  44.11 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4753  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 		 407 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  38.2 
 
 		 398 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  37.95 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 413 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 405 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 405 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  43.65 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.71 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.71 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 403 aa  186  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  40.12 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2534  major facilitator superfamily transporter  45.55 
 
 		 417 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  36.24 
 
 		 411 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  36 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 387 aa  179  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  34.95 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  34.97 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  35.08 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  34.76 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  32.06 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 390 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  37.74 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>