More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3797 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  96.27 
 
 
241 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  58.65 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  58.23 
 
 
237 aa  272  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  58.23 
 
 
236 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  57.56 
 
 
234 aa  269  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  58.23 
 
 
236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  54.62 
 
 
264 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  55.46 
 
 
238 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  54.62 
 
 
265 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  56.72 
 
 
235 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  55.65 
 
 
239 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  54.01 
 
 
242 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
234 aa  263  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  54.01 
 
 
242 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  52.72 
 
 
238 aa  262  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  55.88 
 
 
259 aa  261  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.43 
 
 
234 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  52.52 
 
 
238 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  56.54 
 
 
235 aa  260  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  56.12 
 
 
239 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  55.7 
 
 
239 aa  259  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  56.25 
 
 
251 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  56.9 
 
 
239 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  52.3 
 
 
242 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  52.72 
 
 
239 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  54.62 
 
 
238 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  54.39 
 
 
239 aa  258  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  257  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
237 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 
238 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.23 
 
 
234 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  55.27 
 
 
235 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  55.88 
 
 
245 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  52.74 
 
 
242 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  53.59 
 
 
241 aa  255  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  54.01 
 
 
236 aa  255  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
234 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  52.52 
 
 
237 aa  255  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.37 
 
 
238 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  56.3 
 
 
256 aa  255  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  52.3 
 
 
234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  55.7 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  54.58 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.2 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  53.36 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  252  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  252  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  52.74 
 
 
248 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  49.16 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.37 
 
 
238 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  52.74 
 
 
234 aa  251  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  53.11 
 
 
237 aa  251  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.52 
 
 
238 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  55.04 
 
 
238 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  53.36 
 
 
237 aa  250  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  56.49 
 
 
235 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  54.01 
 
 
236 aa  250  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  49.16 
 
 
238 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
244 aa  249  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  55.46 
 
 
235 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  55.46 
 
 
258 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  51.48 
 
 
244 aa  248  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.32 
 
 
238 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 
233 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  50.84 
 
 
234 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  51.9 
 
 
238 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 
233 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  51.9 
 
 
238 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  51.88 
 
 
236 aa  247  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.48 
 
 
233 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 
235 aa  246  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  52.89 
 
 
247 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  52.89 
 
 
247 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  51.68 
 
 
238 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 
244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  47.92 
 
 
237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  52.74 
 
 
437 aa  244  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.46 
 
 
236 aa  244  6.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  53.53 
 
 
279 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  51.26 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  53.72 
 
 
247 aa  244  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  51.9 
 
 
234 aa  244  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  53.94 
 
 
279 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  53.94 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>