More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3712 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  87.5 
 
 		 448 aa  775    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  96.21 
 
 		 448 aa  852    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 448 aa  885    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  53.08 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.42 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  47.6 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  47.6 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  47.6 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  47.6 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  47.6 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  47.6 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  47.6 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  47.36 
 
 		 426 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 434 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.68 
 
 		 468 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 472 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  45.19 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  33.89 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.33 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  33.5 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 418 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 418 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 450 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  34.61 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  29.5 
 
 		 436 aa  173  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  28.77 
 
 		 447 aa  163  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  32.78 
 
 		 442 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  26.39 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  27.84 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  28.4 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  30.5 
 
 		 429 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  31.15 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  29.08 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  29.89 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  30.48 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  27.64 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4173  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1843  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  27.02 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3708  ATPase domain-containing protein  28.82 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3530  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  28.13 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  27.92 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0322  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0381069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0601  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.5 
 
 		 462 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  25.42 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0463  histidine kinase  27.43 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.916749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  26.39 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>