92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3620 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3620  Trans-aconitate 2-methyltransferase  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  82.76 
 
 		 261 aa  241  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  81.51 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  80.82 
 
 		 262 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  80 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  77.24 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  75.86 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  67.36 
 
 		 256 aa  197  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  66.9 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  65.28 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  65.97 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  62.68 
 
 		 258 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  61.97 
 
 		 258 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  61.97 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  61.97 
 
 		 258 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  86.14 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  85.86 
 
 		 253 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  59.86 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.52 
 
 		 258 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.52 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.52 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.35 
 
 		 256 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.68 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.03 
 
 		 258 aa  137  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.97 
 
 		 259 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  46.53 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.97 
 
 		 260 aa  131  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.35 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.39 
 
 		 257 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.32 
 
 		 260 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.15 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.95 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.65 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  50 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.95 
 
 		 256 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  50.34 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.05 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.92 
 
 		 258 aa  121  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.45 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.76 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.76 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.27 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.27 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.86 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.76 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.37 
 
 		 243 aa  117  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.37 
 
 		 252 aa  117  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.37 
 
 		 252 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  44.37 
 
 		 252 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  44.37 
 
 		 252 aa  117  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.37 
 
 		 252 aa  117  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.37 
 
 		 252 aa  117  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.86 
 
 		 255 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.76 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  43.18 
 
 		 333 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.57 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  45.07 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  44.76 
 
 		 294 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  38.51 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  42.96 
 
 		 257 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  39.19 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.44 
 
 		 255 aa  99.8  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.22 
 
 		 255 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.62 
 
 		 249 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  42.25 
 
 		 250 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  40.51 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.02 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.02 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.02 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.55 
 
 		 252 aa  91.7  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.47 
 
 		 287 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.59 
 
 		 255 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.29 
 
 		 262 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  38.61 
 
 		 344 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  41.73 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.01 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.92 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 		 293 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.59 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.57 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  35.92 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.87 
 
 		 255 aa  72  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.89 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.79 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.21 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0474  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.04 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.901578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.51 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.57 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.56 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  30.49 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>