239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3545 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  99.58 
 
 
239 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  100 
 
 
239 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  78.7 
 
 
241 aa  359  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  64.29 
 
 
241 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  56.96 
 
 
241 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  50.82 
 
 
241 aa  245  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  50.41 
 
 
241 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  48.56 
 
 
240 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  52.25 
 
 
243 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  52.25 
 
 
243 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  52.25 
 
 
243 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  52.25 
 
 
243 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  52.25 
 
 
243 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  52.25 
 
 
243 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  52.25 
 
 
243 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  52.05 
 
 
243 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  47.41 
 
 
246 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  49.19 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  49.19 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  51.11 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  48.78 
 
 
243 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  51.11 
 
 
243 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  50.67 
 
 
243 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  51.11 
 
 
243 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  43.62 
 
 
246 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  42.04 
 
 
245 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  40.49 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  40.49 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  40.49 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  39.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  39.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  39.49 
 
 
276 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  43.27 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  37.23 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  36.86 
 
 
248 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  36.86 
 
 
274 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  38.52 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  38.13 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  38.13 
 
 
277 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  34.55 
 
 
274 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  37.74 
 
 
277 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  37.11 
 
 
277 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  37.11 
 
 
277 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  37.11 
 
 
277 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  33.45 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  33.45 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  34.18 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  34.18 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  33.45 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  36.63 
 
 
274 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  36.07 
 
 
286 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  36.67 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  36.26 
 
 
274 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  36.26 
 
 
290 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  36.26 
 
 
274 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  36.26 
 
 
290 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  36.26 
 
 
290 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  36.26 
 
 
290 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  36.26 
 
 
290 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  34.38 
 
 
274 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  36.29 
 
 
306 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  34.38 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  36.29 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  35.19 
 
 
212 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  35.19 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  35.19 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000820415  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  33.89 
 
 
211 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  33.91 
 
 
212 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  33.91 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  33.91 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  33.91 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  33.91 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  33.91 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  31.62 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  34.09 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  31.06 
 
 
211 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  32.48 
 
 
213 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  35.59 
 
 
212 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  31.06 
 
 
211 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  31.06 
 
 
211 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  30.51 
 
 
210 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  33.61 
 
 
210 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  33.48 
 
 
214 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  35.03 
 
 
212 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  35.03 
 
 
212 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  32.78 
 
 
218 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  35.03 
 
 
212 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  35.03 
 
 
212 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  33.91 
 
 
215 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  31.65 
 
 
223 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0030  OmpW  31.28 
 
 
227 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  33.77 
 
 
214 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  33.33 
 
 
215 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  33.19 
 
 
215 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>