More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3512 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.92 
 
 
462 aa  758    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.97 
 
 
460 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  78.97 
 
 
460 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.83 
 
 
464 aa  827    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
470 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.18 
 
 
458 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.72 
 
 
461 aa  726    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.18 
 
 
460 aa  752    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0372  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.29 
 
 
476 aa  805    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3317  F0F1 ATP synthase subunit beta  96.59 
 
 
467 aa  918    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.0243325 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06104  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.14 
 
 
461 aa  733    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.25 
 
 
461 aa  731    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.9 
 
 
460 aa  745    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.01 
 
 
459 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.82 
 
 
480 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  80 
 
 
463 aa  764    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  78.54 
 
 
459 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.11 
 
 
478 aa  634    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.9 
 
 
460 aa  745    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.76 
 
 
460 aa  747    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00421  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.05 
 
 
467 aa  717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.83 
 
 
464 aa  827    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.48 
 
 
458 aa  751    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.48 
 
 
458 aa  751    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.18 
 
 
458 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.54 
 
 
459 aa  748    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.6 
 
 
477 aa  724    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4114  F0F1 ATP synthase subunit beta  88.63 
 
 
466 aa  837    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.181857  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  94.03 
 
 
467 aa  903    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0308  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.58 
 
 
468 aa  802    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0848804 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.37 
 
 
459 aa  746    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.38 
 
 
475 aa  729    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.57 
 
 
458 aa  761    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.83 
 
 
464 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.55 
 
 
458 aa  777    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.11 
 
 
458 aa  740    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.35 
 
 
458 aa  761    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
468 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
468 aa  639    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.8 
 
 
464 aa  824    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.26 
 
 
464 aa  829    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.72 
 
 
483 aa  726    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
470 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
470 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2165  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.27 
 
 
459 aa  716    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.97 
 
 
460 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  80 
 
 
463 aa  759    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.11 
 
 
458 aa  743    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.73 
 
 
464 aa  751    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.09 
 
 
459 aa  792    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.97 
 
 
458 aa  759    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  80 
 
 
463 aa  759    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.75 
 
 
462 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.83 
 
 
464 aa  827    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3730  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.09 
 
 
465 aa  698    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.4 
 
 
460 aa  753    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.36 
 
 
481 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.45 
 
 
471 aa  798    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
470 aa  640    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5431  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.97 
 
 
458 aa  746    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.59 
 
 
474 aa  795    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3966  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.09 
 
 
470 aa  730    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000531769  normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  80 
 
 
463 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  88.65 
 
 
465 aa  852    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0327  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.11 
 
 
467 aa  787    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.713422  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.83 
 
 
464 aa  821    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.65 
 
 
463 aa  768    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2528  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.84 
 
 
467 aa  718    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.2 
 
 
458 aa  737    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.97 
 
 
458 aa  746    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2327  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.6 
 
 
477 aa  723    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.568138  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  96.38 
 
 
467 aa  917    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0141  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.21 
 
 
457 aa  685    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.773497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
474 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.11 
 
 
460 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.04 
 
 
464 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 
471 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.4 
 
 
461 aa  757    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0420  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.11 
 
 
469 aa  788    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.18 
 
 
458 aa  758    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 
509 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.61 
 
 
457 aa  759    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.83 
 
 
464 aa  827    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.78 
 
 
463 aa  762    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.78 
 
 
463 aa  763    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.61 
 
 
458 aa  763    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.78 
 
 
463 aa  759    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  91.2 
 
 
466 aa  871    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0480  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.86 
 
 
471 aa  800    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.58 
 
 
464 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.11 
 
 
458 aa  743    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.52 
 
 
471 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.83 
 
 
464 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
474 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.92 
 
 
458 aa  759    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.04 
 
 
464 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  80 
 
 
463 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0255  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.95 
 
 
474 aa  780    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0651281  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.22 
 
 
463 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.83 
 
 
464 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>