More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3356 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 382 aa  752    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  97.64 
 
 		 382 aa  686    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  83.64 
 
 		 392 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  52.16 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  52.12 
 
 		 418 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 400 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  58.99 
 
 		 317 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  50.69 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  50.69 
 
 		 385 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  50.69 
 
 		 385 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  58.31 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  50.41 
 
 		 385 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  50.13 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  50.13 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  49.16 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  50.29 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  57.24 
 
 		 318 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  50.29 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  50.29 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  50.29 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  50.29 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  50.29 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  50.29 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  51.86 
 
 		 414 aa  308  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  58.25 
 
 		 299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  55.97 
 
 		 318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  55.63 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  56.95 
 
 		 308 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  58.63 
 
 		 320 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  55.4 
 
 		 307 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  55.4 
 
 		 307 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  50.52 
 
 		 298 aa  282  9e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  54.36 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  45.03 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  55.05 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  54.7 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  46.11 
 
 		 389 aa  272  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  51.84 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  36.57 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.57 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  42.5 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 388 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  39.32 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  35.61 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  35.91 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  39.23 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  39.23 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  41.23 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  33.95 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  34.72 
 
 		 289 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  34.72 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 300 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 306 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  33.33 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  31.42 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  30.95 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  32.78 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 		 297 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  30.61 
 
 		 298 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.61 
 
 		 298 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  30.61 
 
 		 298 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.61 
 
 		 297 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  30.61 
 
 		 297 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  30.03 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  30.27 
 
 		 297 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  34.81 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  29.69 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 		 299 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  35.55 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  32.73 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 307 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  30.77 
 
 		 299 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 		 299 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 306 aa  136  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5408  cation efflux protein  42.93 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362512  normal  0.663662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  32.76 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  32.76 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.61 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  32.76 
 
 		 293 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  32.42 
 
 		 296 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  32.42 
 
 		 296 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  32.42 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  32.42 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>