More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3303 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
419 aa  788  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  91.41 
 
 
419 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  48.63 
 
 
416 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  42.64 
 
 
393 aa  282  9e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  41.27 
 
 
389 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  41.27 
 
 
389 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  44.09 
 
 
398 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  45.93 
 
 
433 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 
402 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  44 
 
 
401 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  46.3 
 
 
422 aa  246  7e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.83 
 
 
404 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  43.96 
 
 
398 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  41.25 
 
 
404 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
402 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  43.8 
 
 
398 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.95 
 
 
405 aa  226  5e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.4 
 
 
395 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  38.8 
 
 
405 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  39.45 
 
 
405 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  43.09 
 
 
396 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 
447 aa  221  1e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  41.19 
 
 
407 aa  221  2e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  44.22 
 
 
408 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  39.79 
 
 
400 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  45.5 
 
 
427 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  1.15228e-11 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  39.79 
 
 
400 aa  217  3e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.43 
 
 
400 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
388 aa  215  1e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  38.11 
 
 
405 aa  214  2e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  38.11 
 
 
405 aa  214  2e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  38.11 
 
 
405 aa  214  2e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  46.5 
 
 
431 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.5695e-06  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  47.44 
 
 
422 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  6.23855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  47.44 
 
 
433 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  2.91886e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  47.44 
 
 
442 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  40.35 
 
 
406 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  47.85 
 
 
427 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.69004e-05  unclonable  5.14998e-11 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  47.85 
 
 
427 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.78785e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  47.85 
 
 
427 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  41.85 
 
 
413 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
397 aa  197  4e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.13 
 
 
399 aa  197  4e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.87 
 
 
399 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  38.42 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  45.33 
 
 
401 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.62 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  34.04 
 
 
394 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  43.38 
 
 
399 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  40.57 
 
 
400 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  36.15 
 
 
404 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  45.13 
 
 
409 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  36.32 
 
 
385 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  42.14 
 
 
399 aa  183  4e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.42 
 
 
405 aa  183  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.8 
 
 
400 aa  182  8e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  41.9 
 
 
399 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  48.14 
 
 
423 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  8.03869e-10 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 
415 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  44.68 
 
 
402 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  48.14 
 
 
425 aa  180  3e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  36.14 
 
 
426 aa  180  3e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  36.09 
 
 
399 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  37.85 
 
 
394 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  36.09 
 
 
399 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  36.09 
 
 
399 aa  179  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.77 
 
 
395 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
399 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
394 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  36.96 
 
 
415 aa  174  2e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  30.73 
 
 
406 aa  174  3e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  30.73 
 
 
403 aa  174  3e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.58101e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  30.73 
 
 
406 aa  174  3e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 
394 aa  174  3e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  30.56 
 
 
392 aa  174  3e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 
389 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  37.06 
 
 
405 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  37.06 
 
 
399 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  37.06 
 
 
399 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  37.06 
 
 
399 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  37.06 
 
 
399 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  37.06 
 
 
399 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  37.06 
 
 
399 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  38.15 
 
 
399 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  38.24 
 
 
403 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  37.67 
 
 
389 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  39.02 
 
 
403 aa  166  7e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
410 aa  166  7e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  32.67 
 
 
403 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  35.6 
 
 
394 aa  166  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  41.39 
 
 
399 aa  166  1e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
403 aa  164  2e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
419 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
423 aa  164  4e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  38.27 
 
 
410 aa  162  8e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
413 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  38.42 
 
 
403 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  39.13 
 
 
412 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
413 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  32.67 
 
 
383 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>