231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3245 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  98.21 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  82.93 
 
 		 224 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  52.27 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  52.86 
 
 		 208 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  51.9 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  50.48 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  46.64 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  51.13 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  48.42 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  50.47 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  50.47 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  46.9 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  52.6 
 
 		 196 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  51.47 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  48.13 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  49.21 
 
 		 198 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  39.8 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  42.73 
 
 		 210 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  38.39 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  37.05 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  41.05 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  36.61 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  41.05 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  41.05 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  42.44 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  41.58 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  40.53 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  40.53 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  40.53 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  41.88 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  34.09 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  34.09 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  34.09 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  34.09 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  34.09 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  44.1 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  44.1 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  42.03 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  33.64 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  36.13 
 
 		 194 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  36.13 
 
 		 194 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  39.92 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  41.36 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  40.2 
 
 		 229 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  42 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  41.45 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  43.52 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  41.58 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  42.27 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  38.27 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  36.98 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  36.41 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  33.98 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  39.9 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  35 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  35 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  33.04 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  36.27 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  33.49 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  29.84 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  35 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  32.57 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  35.35 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  36.08 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  36.08 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  32.73 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  33.18 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  31.96 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  36.36 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  32.89 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  31.82 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  32.9 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  31.53 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  31.84 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  34.33 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  34.03 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  34.23 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  31.03 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  29.68 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  30.67 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  30.15 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  31.98 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  0.0000209029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  32.54 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  32.75 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  32.31 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  31.1 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  31.52 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  31.14 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  31.36 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  31.75 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  34.78 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  32.99 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  29.95 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  30.61 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  32.78 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  29.76 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  32.37 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>