More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3148 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  96.33 
 
 		 300 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  79.86 
 
 		 306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  62.64 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  61.17 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.64 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  56.57 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  57.09 
 
 		 280 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  55.26 
 
 		 286 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  56.72 
 
 		 280 aa  254  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  55.64 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  55.64 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  55.97 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  55.64 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  54.1 
 
 		 285 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  55.6 
 
 		 280 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.57 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  54.48 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  54.48 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  51.35 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  54.48 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  54.48 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  51.87 
 
 		 289 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  54.48 
 
 		 285 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  54.48 
 
 		 285 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  54.1 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  51.69 
 
 		 270 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.72 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  45.82 
 
 		 283 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  50.58 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.83 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  49.08 
 
 		 274 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.51 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.44 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  45.45 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  49.29 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.98 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.98 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  51.08 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  46.18 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  51.5 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.59 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  45.26 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  42.2 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  46.88 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  46.56 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.15 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.16 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  50.39 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  51.31 
 
 		 280 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  41.78 
 
 		 285 aa  208  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  51.7 
 
 		 275 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  46.55 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.24 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  47.06 
 
 		 275 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  42.53 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  42.15 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  51.75 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.34 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.34 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  44.83 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  41.98 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.34 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.34 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  42.15 
 
 		 287 aa  201  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.34 
 
 		 277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  46.35 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.58 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  44.19 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.18 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.17 
 
 		 276 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.13 
 
 		 276 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.54 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  41.54 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.54 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  41.18 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  51.13 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.18 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.18 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  42.05 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.18 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  42.08 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  41.38 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.18 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  41 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  41.7 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  45.95 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  41 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  41 
 
 		 282 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  47.29 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  45.85 
 
 		 286 aa  195  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  38.89 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  41.31 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  42.15 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  41.31 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  42.8 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  50.68 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  45.36 
 
 		 276 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  40.78 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>