129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3128 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  90.37 
 
 		 219 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2886  hypothetical protein  77.27 
 
 		 223 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  47.44 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  47.44 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  47.44 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  47.44 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  47.44 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  51.43 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  51.43 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  46.54 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  46.54 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  41.86 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  45.12 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  42.2 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  45.58 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  45.58 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  40.47 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  46.51 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  44.19 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  46.51 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  46.05 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  45.12 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  37.26 
 
 		 495 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  39.06 
 
 		 540 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  35.16 
 
 		 508 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  37.72 
 
 		 505 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  40.54 
 
 		 511 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  36.07 
 
 		 508 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  35.68 
 
 		 435 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  36.07 
 
 		 508 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  35.68 
 
 		 435 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  35.68 
 
 		 435 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 487 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  36.07 
 
 		 508 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  35.98 
 
 		 433 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  36.07 
 
 		 498 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  35.98 
 
 		 433 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  35.98 
 
 		 433 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  35.98 
 
 		 433 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  36.57 
 
 		 443 aa  94.7  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  35.98 
 
 		 433 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  36.79 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  36.28 
 
 		 503 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  35.98 
 
 		 433 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  33.49 
 
 		 495 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  37.39 
 
 		 347 aa  92.8  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  41.98 
 
 		 291 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  35.51 
 
 		 433 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  35.07 
 
 		 433 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  36.82 
 
 		 499 aa  91.7  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  34.6 
 
 		 433 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 494 aa  91.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  34.6 
 
 		 433 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  34.6 
 
 		 433 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  35.51 
 
 		 433 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  35.51 
 
 		 433 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  32.26 
 
 		 500 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 445 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  34.6 
 
 		 433 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  32.87 
 
 		 443 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  35.84 
 
 		 505 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  32.56 
 
 		 529 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 435 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  32.72 
 
 		 500 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  35.16 
 
 		 503 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  40.24 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  35.16 
 
 		 503 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  37.56 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  33.02 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  30.7 
 
 		 510 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  29.41 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  35.85 
 
 		 433 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  32.08 
 
 		 505 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  33.95 
 
 		 503 aa  82  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  30.88 
 
 		 501 aa  82  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  33.02 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  36.87 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  38.36 
 
 		 512 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  36.13 
 
 		 454 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  40.88 
 
 		 489 aa  78.2  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  34.56 
 
 		 492 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  40.88 
 
 		 489 aa  78.2  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  30.41 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  38.25 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  29.95 
 
 		 535 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  36.15 
 
 		 512 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68810  hypothetical protein  33.18 
 
 		 454 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  37.56 
 
 		 509 aa  75.1  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  34.42 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  31.84 
 
 		 502 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  32.88 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  35.81 
 
 		 511 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  33.99 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  34.19 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5421  adenylate cyclase  34.62 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274372  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  33.15 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  35.48 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  35.48 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  34.29 
 
 		 511 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>