31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3105 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  96.16 
 
 
365 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  100 
 
 
365 aa  741    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  85.83 
 
 
384 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  65.67 
 
 
385 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  62.54 
 
 
379 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  53.55 
 
 
369 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  53.46 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  51.33 
 
 
357 aa  311  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  51.15 
 
 
399 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  49.85 
 
 
374 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  48.88 
 
 
360 aa  298  9e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  46.57 
 
 
363 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  46.29 
 
 
376 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  46.88 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  46.88 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  45.51 
 
 
387 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  45.14 
 
 
442 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  46.75 
 
 
357 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  45.67 
 
 
363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  46.06 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  47.96 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  48.77 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  47.02 
 
 
336 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  44.44 
 
 
351 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  42.99 
 
 
351 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  43.32 
 
 
385 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  42.74 
 
 
355 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  36.9 
 
 
356 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  27.11 
 
 
340 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  31.75 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  30.41 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>