More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3084 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2839  cell division protein FtsZ  96.5 
 
 
400 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412963  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2974  cell division protein FtsZ  89.55 
 
 
398 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00404653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3123  cell division protein FtsZ  90.25 
 
 
396 aa  668    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250037  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2719  cell division protein FtsZ  99.75 
 
 
399 aa  804    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147554  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3084  cell division protein FtsZ  100 
 
 
399 aa  807    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15044  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3238  cell division protein FtsZ  82.09 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2545  cell division protein FtsZ  82.09 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3539  cell division protein FtsZ  82.09 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1123  cell division protein FtsZ  82.09 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3545  cell division protein FtsZ  82.09 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0491  cell division protein FtsZ  82.38 
 
 
398 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000439122  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0466  cell division protein FtsZ  82.09 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3520  cell division protein FtsZ  82.09 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1325  cell division protein FtsZ  82.09 
 
 
398 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3650  cell division protein FtsZ  83.08 
 
 
398 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000496958  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3465  cell division protein FtsZ  82.13 
 
 
398 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000236029  hitchhiker  0.00102035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0082  cell division protein FtsZ  83.08 
 
 
398 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000308232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0564  cell division protein FtsZ  83.08 
 
 
398 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000183043  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0535  cell division protein FtsZ  83.08 
 
 
398 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000909703  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0493  cell division protein FtsZ  82.84 
 
 
398 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272239  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2668  cell division protein FtsZ  82.38 
 
 
397 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000509241  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0468  cell division protein FtsZ  82.84 
 
 
398 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2831  cell division protein FtsZ  82.84 
 
 
398 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000122218  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0186  cell division protein FtsZ  66.82 
 
 
446 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103682  normal  0.437906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0172  cell division protein FtsZ  67.94 
 
 
446 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000198295  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2975  cell division protein FtsZ  63.41 
 
 
409 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00368493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3665  cell division protein FtsZ  63.41 
 
 
409 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0666491  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3493  cell division protein FtsZ  64.04 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00398885  normal  0.338691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1080  cell division protein FtsZ  63.26 
 
 
409 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000021674  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0467  cell division protein FtsZ  64.88 
 
 
405 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0310638  normal  0.0832153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0826  cell division protein FtsZ  62.86 
 
 
410 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  normal  0.584414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3420  cell division protein FtsZ  61.34 
 
 
417 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000881551  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4575  cell division protein FtsZ  61.02 
 
 
413 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213965  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0527  cell division protein FtsZ  63.05 
 
 
405 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3412  cell division protein FtsZ  62.84 
 
 
394 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000669167  normal  0.43069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2263  cell division protein FtsZ  58.21 
 
 
387 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00432482  hitchhiker  0.000536698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0924  cell division protein FtsZ  61.52 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00449879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1475  cell division protein FtsZ  61.17 
 
 
412 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658975  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0125  cell division protein FtsZ  57.75 
 
 
380 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0593594  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3422  cell division protein FtsZ  60.9 
 
 
380 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588634  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2488  cell division protein FtsZ  56.54 
 
 
389 aa  363  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0022713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0927  cell division protein FtsZ  52.66 
 
 
397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000000829839  normal  0.686673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2447  cell division protein FtsZ  53.83 
 
 
385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00131547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0653  cell division protein FtsZ  52.39 
 
 
383 aa  325  9e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0775  cell division protein FtsZ  52.37 
 
 
384 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4979  cell division protein FtsZ  52.52 
 
 
394 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0056047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0615  cell division protein FtsZ  52.13 
 
 
383 aa  323  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000348627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0766  cell division protein FtsZ  51.86 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000874251  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0607  cell division protein FtsZ  52.78 
 
 
411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3382  cell division protein FtsZ  52.39 
 
 
383 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3513  cell division protein FtsZ  52.39 
 
 
383 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000471065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2913  cell division protein FtsZ  52.39 
 
 
383 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000966875  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3587  cell division protein FtsZ  51.84 
 
 
383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00015207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3775  cell division protein FtsZ  51.84 
 
 
383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000884705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2195  cell division protein FtsZ  54.48 
 
 
385 aa  319  5e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000389118  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4668  cell division protein FtsZ  50.92 
 
 
398 aa  319  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910639  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13300  cell division protein FtsZ  52.25 
 
 
394 aa  319  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00394916  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0517  cell division protein FtsZ  50 
 
 
390 aa  319  6e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4097  cell division protein FtsZ  50.4 
 
 
395 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0231249  normal  0.411425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004486  cell division protein FtsZ  49.03 
 
 
412 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000238427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0641  cell division protein FtsZ  51.6 
 
 
383 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000009696  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0145  cell division protein FtsZ  51.6 
 
 
383 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0351517  hitchhiker  0.00000964056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4459  cell division protein FtsZ  50.87 
 
 
386 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0149  cell division protein FtsZ  51.6 
 
 
383 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000359528  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0145  cell division protein FtsZ  51.6 
 
 
383 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000120308  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0150  cell division protein FtsZ  51.6 
 
 
383 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000113704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57275  cell division protein FtsZ  51.72 
 
 
394 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000484485  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1975  cell division protein FtsZ  51.26 
 
 
398 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000804348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4403  cell division protein FtsZ  50.4 
 
 
395 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00309218  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2043  cell division protein FtsZ  54.13 
 
 
411 aa  315  6e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000892067  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1964  cell division protein FtsZ  53.64 
 
 
411 aa  315  9e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000893853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00096  cell division protein FtsZ  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3505  cell division protein FtsZ  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0103  cell division protein FtsZ  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000359609  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0088  cell division protein FtsZ  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00095  hypothetical protein  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0097  cell division protein FtsZ  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000652178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0101  cell division protein FtsZ  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.47391e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3562  cell division protein FtsZ  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000263859  normal  0.0129736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0100  cell division protein FtsZ  50.65 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  normal  0.622573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0853  cell division protein FtsZ  52.85 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155156  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0142  cell division protein FtsZ  51.33 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000809484  normal  0.893784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2185  cell division protein FtsZ  51.42 
 
 
394 aa  312  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000751691  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00906  cell division protein FtsZ  46.81 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2609  cell division protein FtsZ  51.97 
 
 
409 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000986054  unclonable  0.00000000000462824 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2085  cell division protein FtsZ  50.25 
 
 
386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.150448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04362  cell division protein FtsZ  53.06 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3514  cell division protein FtsZ  48.33 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000411228  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0358  cell division protein FtsZ  51.37 
 
 
394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000326456  unclonable  0.00000763444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2423  cell division protein FtsZ  49.75 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0258249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0414  cell division protein FtsZ  50.13 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  hitchhiker  0.00156987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3739  cell division protein FtsZ  50.61 
 
 
395 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000117784  unclonable  0.000000000119361 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0379  cell division protein FtsZ  49.13 
 
 
387 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000173126  normal  0.037859 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0200  cell division protein FtsZ  49.13 
 
 
387 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.719937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4215  cell division protein FtsZ  50.61 
 
 
395 aa  301  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2640  cell division protein FtsZ  48.42 
 
 
411 aa  302  9e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000115675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3807  cell division protein FtsZ  49.88 
 
 
395 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000351722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3566  cell division protein FtsZ  50.61 
 
 
395 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000796919  decreased coverage  0.000000000512084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0390  cell division protein FtsZ  50.61 
 
 
395 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00071655  unclonable  0.00003574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0560  cell division protein FtsZ  50.12 
 
 
396 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>