112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3037 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3037  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 155 aa  303  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2627  17 kDa surface antigen  98.71 
 
 		 155 aa  300  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.940371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  87.1 
 
 		 155 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  65.16 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3070  17 kDa surface antigen  65.81 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0526  putative outer membrane lipoprotein, SlyB-like  51.27 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0527356  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3432  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0130273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2635  17 kDa surface antigen  49.68 
 
 		 162 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3682  outer membrane lipoprotein  55.7 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0116  17 kDa surface antigen  53.38 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.72771  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0599  17 kDa surface antigen  53.38 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0568  17 kDa surface antigen  53.38 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  decreased coverage  0.000059328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0501  17 kDa surface antigen  52.7 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.354763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0525  17 kDa surface antigen  52.7 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2785  17 kDa surface antigen  51.35 
 
 		 157 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2507  outer membrane lipoprotein  53.38 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3507  outer membrane lipoprotein  53.38 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1157  outer membrane lipoprotein  53.38 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0428  outer membrane lipoprotein  53.38 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1287  outer membrane lipoprotein  53.38 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3471  outer membrane lipoprotein  53.38 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.31165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3509  outer membrane lipoprotein  53.38 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3277  outer membrane lipoprotein  53.38 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1151  17 kDa surface antigen  45.95 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.965272  normal  0.0962172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3449  17 kDa surface antigen  46.4 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1167  17 kDa surface antigen  44.59 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1131  17 kDa surface antigen  43.92 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4284  17 kDa surface antigen  43.92 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4325  hypothetical protein  39.74 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138091  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6233  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  34.21 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0997303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50740  hypothetical protein  40.54 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0208  surface antigen protein  48 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3852  lipoprotein SlyB, putative  43.92 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1231  surface antigen protein  43.14 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19520  outer membrane lipoprotein  39.1 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  36.43 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1150  Outer membrane lipoprotein-like  38.85 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527599  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0170  outer membrane lipoprotein, putative  47.41 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0832777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003797  putative outer membrane lipoprotein Pcp  31.21 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0804  17 kDa surface antigen  40.16 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4115  lipoprotein SlyB, putative  43.92 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.404382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2215  17 kDa surface antigen  36.81 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.443445  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2965  17 kDa surface antigen  37.24 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.879461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0915  17 kDa surface antigen  40.56 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.852143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  31.85 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1440  17 kDa surface antigen  39.74 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.390363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1612  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  38.96 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5253  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  38.96 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438086  normal  0.967685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  33.57 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  35.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  35.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  35.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  35.58 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1723  17 kDa surface antigen  37.59 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  36.11 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  36.84 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  33.54 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  33.54 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  41.58 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1690  17 kDa surface antigen  37.86 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  36.11 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  34.29 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  32.91 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  30.67 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6520  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  27.59 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  33.59 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  34.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  33.02 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  33.02 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  29.73 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0424  outer membrane lipoprotein  57.14 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5596  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  29.23 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0952  outer membrane lipoprotein pcp precursor  35.38 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.013543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  35.21 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  33.62 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2665  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2250  17 kDa surface antigen  29.19 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454882  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  34.27 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  34.27 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  34.27 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  34.27 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  34.27 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2381  17 kDa surface antigen  37.76 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00375113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  32.41 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4999  hypothetical protein  31.39 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>