More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3028 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
174 aa  358  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  97.13 
 
 
174 aa  350  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  82.76 
 
 
174 aa  307  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  62.07 
 
 
182 aa  195  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  62.59 
 
 
180 aa  193  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  55.63 
 
 
182 aa  171  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  51.11 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  53.19 
 
 
202 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  53.19 
 
 
186 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  53.19 
 
 
186 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  51.85 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  51.85 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  51.85 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  51.85 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  42.86 
 
 
183 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  43.82 
 
 
180 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  50.37 
 
 
183 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  49.63 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  49.63 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  49.63 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  49.63 
 
 
184 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  47.41 
 
 
183 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  51.11 
 
 
182 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.46 
 
 
175 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  41.04 
 
 
178 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  48 
 
 
195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  47.29 
 
 
195 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.29 
 
 
195 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  39.75 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  41.35 
 
 
180 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.5 
 
 
182 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  40.14 
 
 
188 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  40.69 
 
 
172 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.22 
 
 
195 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  37.68 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  35.97 
 
 
190 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  40.3 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.97 
 
 
187 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  34.9 
 
 
165 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  35.29 
 
 
164 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  32.9 
 
 
173 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.24 
 
 
185 aa  97.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  31.61 
 
 
167 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  29.09 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.92 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  28.8 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.5 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.82 
 
 
180 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  41.94 
 
 
209 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.43 
 
 
288 aa  85.1  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  36.22 
 
 
200 aa  84.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1042  thiol:disulfide interchange protein like protein  37.61 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  33.33 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  35 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  38.71 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  35 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  29.23 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.62 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3457  hypothetical protein  38.17 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.01 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  36.84 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.43 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  31.33 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  29.03 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.4 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  30.53 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.7 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  33.33 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.79 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  35.77 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  36.43 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  31.2 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  35.71 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0984  thioredoxin  35.59 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  35.16 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  38.69 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.09 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  32.08 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  34.75 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.54 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  39.47 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5968  Redoxin domain protein  30.82 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566817  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  36.8 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.57 
 
 
247 aa  71.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  33.07 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  23.95 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.82 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.75 
 
 
228 aa  70.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  29.93 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0209  periplasmic protein thiol  36.89 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0534506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  24.71 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  35.11 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  32.46 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>