More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2858 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
351 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.693195  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  98.01 
 
 
351 aa  701    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2623  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  93.77 
 
 
353 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.622864  normal  0.159504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  85.75 
 
 
350 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  86.04 
 
 
350 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.2 
 
 
351 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.2 
 
 
351 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.2 
 
 
351 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.2 
 
 
351 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.2 
 
 
351 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.2 
 
 
351 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  80.91 
 
 
351 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  80.63 
 
 
351 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3848  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.48 
 
 
351 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375893  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.48 
 
 
351 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.48 
 
 
351 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  81.48 
 
 
351 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  80.63 
 
 
351 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0655  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  80.63 
 
 
351 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2487  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  80.29 
 
 
355 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0680  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  80.57 
 
 
351 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  74.13 
 
 
346 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0748  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  80 
 
 
355 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3645  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3936  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  79.43 
 
 
355 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  77.94 
 
 
355 aa  511  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  72.41 
 
 
350 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  73.08 
 
 
379 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3174  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  77.17 
 
 
347 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315286  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.92 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1476  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  70.64 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2185  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.41 
 
 
350 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  68.13 
 
 
345 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.652409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1465  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.57 
 
 
346 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  65.9 
 
 
356 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2667  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  73.87 
 
 
312 aa  448  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.729268  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2994  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.96 
 
 
349 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.429765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2512  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.16 
 
 
349 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  65.52 
 
 
358 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2421  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  66.1 
 
 
349 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1970  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  67.55 
 
 
352 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.023666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.85 
 
 
349 aa  428  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.56 
 
 
358 aa  428  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60 
 
 
352 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.99 
 
 
369 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.82 
 
 
345 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.06 
 
 
345 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.81 
 
 
352 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.56 
 
 
349 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  63.36 
 
 
410 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.71 
 
 
345 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.56 
 
 
353 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.82 
 
 
350 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.82 
 
 
345 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  61.22 
 
 
352 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.82 
 
 
359 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.82 
 
 
345 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.82 
 
 
350 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.82 
 
 
345 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.82 
 
 
345 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.93 
 
 
352 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.12 
 
 
345 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.77 
 
 
353 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.4 
 
 
352 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.17 
 
 
346 aa  418  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.4 
 
 
352 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1650  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.27 
 
 
368 aa  418  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.81226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.95 
 
 
354 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.76 
 
 
346 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.4 
 
 
352 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.11 
 
 
352 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1720  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.27 
 
 
368 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.86 
 
 
352 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.05 
 
 
347 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  60.76 
 
 
363 aa  414  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.43 
 
 
345 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.94 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.65 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.65 
 
 
347 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.85 
 
 
347 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.06 
 
 
352 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.3 
 
 
345 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.65 
 
 
347 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  61.47 
 
 
351 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.01 
 
 
345 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.11 
 
 
353 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.94 
 
 
345 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
346 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.72 
 
 
345 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.69 
 
 
346 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.01 
 
 
345 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.01 
 
 
345 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.3 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>