130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2813 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  96.21 
 
 		 343 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 343 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  88.99 
 
 		 358 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  65.71 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000523356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  63.17 
 
 		 341 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  53.33 
 
 		 338 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  50.47 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  49.38 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3262  hypothetical protein  46.04 
 
 		 333 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  47.04 
 
 		 332 aa  278  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  41.95 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38320  bile acid/Na+ symporter family transporter  46.93 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2103  Bile acid:sodium symporter  45.28 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  44.55 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  45.37 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  45.2 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3402  hypothetical protein  47.81 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  45.29 
 
 		 346 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  46.15 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000897855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0648  transporter, putative  48.11 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  45.29 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  45.29 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  45.29 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  45.29 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  45.29 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  45.29 
 
 		 382 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  47.5 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  45.86 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  48.41 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  47.22 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  45.86 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000261961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  45.86 
 
 		 332 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000209356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  45.56 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000832535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  45.56 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  45.56 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  45.56 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000983747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  45.56 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000908139  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  44.64 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  43.47 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  44.85 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  44.35 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  44.35 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  45.23 
 
 		 334 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  44.35 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1906  Bile acid:sodium symporter  43.99 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  44.35 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  46.08 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0747  transporter, putative  46.11 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  41.87 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  43.21 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  43.96 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  43.84 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  46.65 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  44.24 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  46.78 
 
 		 336 aa  251  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6319  bile acid/sodium symporter  44.24 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4282  putative sodium/bile acid symporter family protein  45.78 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2965  bile acid:sodium symporter  43.03 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  44.27 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2990  bile acid:sodium symporter  45.31 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  45 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2356  bile acid:sodium symporter  44.44 
 
 		 343 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2970  bile acid:sodium symporter  44.44 
 
 		 343 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  45.48 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0427  Bile acid:sodium symporter  45.17 
 
 		 342 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  43.87 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  45.65 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  45.34 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2266  putative sodium/bile acid symporter family protein  43.56 
 
 		 342 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  44.69 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1994  hypothetical protein  43.56 
 
 		 342 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3906  bile acid:sodium symporter  41.74 
 
 		 378 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3320  Bile acid:sodium symporter  45.66 
 
 		 334 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2250  hypothetical protein  43.34 
 
 		 332 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3255  bile acid:sodium symporter  44.59 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  45.85 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  45.12 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1899  Bile acid:sodium symporter  42.15 
 
 		 338 aa  238  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  42.68 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3619  Bile acid:sodium symporter  44.87 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  43.67 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1098  bile acid:sodium symporter  43.3 
 
 		 336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  47.1 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  40.92 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2484  bile acid:sodium symporter  40.06 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  41.82 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  41.88 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  43.89 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  41.72 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  41.72 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  40.51 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  43.48 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  39.12 
 
 		 329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4668  Na+-dependent transporter-like protein  42.9 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0673  lipoprotein transmembrane protein  40.25 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.74924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3838  Na+-dependent transporter-like protein  43.37 
 
 		 312 aa  206  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37202  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4379  bile acid:sodium symporter  40.63 
 
 		 322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  40.35 
 
 		 328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4204  bile acid:sodium symporter  40.36 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2649  bile acid:sodium symporter  47.94 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>