198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2764 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  100 
 
 		 136 aa  270  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  75.74 
 
 		 136 aa  217  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  77.94 
 
 		 136 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  60 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  58.02 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  61.9 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  61.9 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  52.27 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  62.16 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  50 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  50 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  63.49 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  54.55 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  52.99 
 
 		 174 aa  137  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  53.73 
 
 		 174 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  49.62 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  51.18 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  48.82 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1283  DoxX family protein  51.16 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  54.46 
 
 		 182 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  49.61 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  49.61 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  49.61 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  49.61 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  49.61 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  49.61 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  49.61 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  49.61 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  53.79 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  53.79 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  53.79 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  52.27 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  51.52 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  48.03 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3817  DoxX  51.52 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4551  DoxX family protein  51.52 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5753  DoxX family protein  51.52 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3904  DoxX family protein  55.88 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1243  DoxD-like family protein  55.36 
 
 		 167 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0214  DoxD-like family protein  55.36 
 
 		 167 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0487  DoxD-like family protein  55.36 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1085  DoxX family protein  55.36 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2591  DoxD-like family protein  56.25 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1351  DoxX family protein  56.25 
 
 		 167 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0214907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1436  DoxX family protein  56.25 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.921466  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  52.34 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  44.53 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  43.85 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  41.3 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  41.3 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  42.54 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  42.54 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  42.54 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  42.54 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  42.54 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  44 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  41.79 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  41.79 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  41.98 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  43.65 
 
 		 161 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  43.65 
 
 		 161 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  43.65 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  43.65 
 
 		 161 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0372  DoxX family protein  39.29 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  43.65 
 
 		 161 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  38.06 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  38.81 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  40.8 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  37.3 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  38.06 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  44.35 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40.62 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  36.3 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  36.3 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  36.3 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  38.1 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  36.36 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  38.1 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  40.48 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  41.27 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  40.34 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3519  DoxX family protein  37.88 
 
 		 131 aa  83.6  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  37.3 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1786  DoxX family protein  45.37 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  32.56 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1986  DoxX family protein  44.44 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2535  DoxX  39.29 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47840  DoxX-like protein  38.76 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2074  DoxD-like family protein  33.87 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0520  DoxX family protein  37.88 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3393  DoxX family protein  38.64 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  39.83 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  38.84 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  35.29 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0738  DoxX family protein  37.12 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  35.07 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5736  DoxX family protein  43 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1966  DoxX family protein  38.6 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  36.36 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  32.23 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>