More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2691 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 		 313 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  99.36 
 
 		 313 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  93.61 
 
 		 313 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  85.3 
 
 		 313 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  83.39 
 
 		 313 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 		 313 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 		 313 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 		 313 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 		 313 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 		 313 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 		 313 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  74.44 
 
 		 313 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  74.76 
 
 		 313 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  74.44 
 
 		 313 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  72.84 
 
 		 313 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  73.16 
 
 		 313 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  71.88 
 
 		 313 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  55.27 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  56.55 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  55.91 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  55 
 
 		 317 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  55.41 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  54.14 
 
 		 314 aa  362  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  54.95 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  54.63 
 
 		 313 aa  358  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  54.95 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 		 308 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  54.57 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  55.74 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  55.74 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 312 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  55.41 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  54.73 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  54.73 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  55.25 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  55.07 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  53.95 
 
 		 308 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  53.95 
 
 		 308 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  53.62 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  55.08 
 
 		 316 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  53.95 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  53.95 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  54.43 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  52.63 
 
 		 320 aa  340  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  54.28 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2112  transcriptional regulator CysB-like protein  55.49 
 
 		 317 aa  338  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  54.15 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  51.96 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  52.61 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  52.79 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  54.92 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  52.13 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  50.64 
 
 		 312 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  48.88 
 
 		 313 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  54.72 
 
 		 314 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  50.98 
 
 		 309 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  50.34 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  52.79 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  48.68 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  50 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  46.82 
 
 		 335 aa  299  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  46.65 
 
 		 324 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  46.65 
 
 		 324 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  46.65 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  46.77 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  46.73 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  45.9 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  45.9 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  45.9 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  0.0000181404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  46.69 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  45.7 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  46.96 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  46.01 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  46.45 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  46.01 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  45.57 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  45.25 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  46.45 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  46.67 
 
 		 324 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1805  transcriptional regulator CysB  46.03 
 
 		 324 aa  291  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  46.53 
 
 		 325 aa  291  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  45.25 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>