More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2645 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 		 345 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  95.94 
 
 		 344 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  93.04 
 
 		 344 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  93.04 
 
 		 344 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  89.86 
 
 		 354 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  92.64 
 
 		 350 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  87.85 
 
 		 353 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  87.64 
 
 		 356 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  87.08 
 
 		 356 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  91.41 
 
 		 358 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.14 
 
 		 350 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  84.23 
 
 		 355 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  83.99 
 
 		 356 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.68 
 
 		 351 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  83.52 
 
 		 349 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  86.67 
 
 		 348 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  80.8 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.55 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.21 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  63.09 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.78 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  61.02 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.21 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  60.97 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  62.83 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.76 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  61.22 
 
 		 326 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  59.24 
 
 		 327 aa  362  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  60.2 
 
 		 305 aa  361  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.52 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.49 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.43 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.76 
 
 		 326 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.49 
 
 		 327 aa  358  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.49 
 
 		 327 aa  358  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  61.29 
 
 		 322 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.75 
 
 		 322 aa  359  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.05 
 
 		 325 aa  358  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  59.49 
 
 		 334 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  62.08 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  61.29 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.81 
 
 		 334 aa  355  7.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.94 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  60.78 
 
 		 327 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  59.74 
 
 		 334 aa  352  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.67 
 
 		 333 aa  351  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.07 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  60.88 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.46 
 
 		 329 aa  338  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  61.02 
 
 		 327 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  60.47 
 
 		 327 aa  322  6e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.53 
 
 		 323 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  51.94 
 
 		 320 aa  312  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  55.21 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  49.51 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  48.36 
 
 		 325 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  49.36 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  47.06 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  49.04 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  47.21 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  47.21 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  46.86 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  44.41 
 
 		 366 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  46.86 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  47 
 
 		 321 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.07 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.27 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  42.11 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  40.8 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  41.33 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  44.04 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.65 
 
 		 309 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.96 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.52 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  42.86 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  43.19 
 
 		 322 aa  222  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.52 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  37.34 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.31 
 
 		 473 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  36.71 
 
 		 450 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  36.1 
 
 		 449 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  34.13 
 
 		 412 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  33.76 
 
 		 451 aa  165  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  30.63 
 
 		 572 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  35.9 
 
 		 464 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  35.88 
 
 		 432 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  32.04 
 
 		 589 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  35.22 
 
 		 468 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  35.2 
 
 		 469 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.88 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  35.92 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 479 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.83 
 
 		 452 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  35.1 
 
 		 460 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  35 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  35 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  35 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  35.1 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2761  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>