57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2644 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 154 aa  306  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  92.81 
 
 		 154 aa  284  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  90.85 
 
 		 154 aa  278  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  91.5 
 
 		 148 aa  274  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  88.24 
 
 		 154 aa  270  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  87.58 
 
 		 154 aa  269  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  87.58 
 
 		 154 aa  269  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  88.24 
 
 		 158 aa  268  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  87.58 
 
 		 154 aa  266  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  88.16 
 
 		 158 aa  266  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  87.58 
 
 		 158 aa  265  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  89.54 
 
 		 154 aa  263  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  89.36 
 
 		 154 aa  259  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  90.07 
 
 		 154 aa  259  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  89.36 
 
 		 154 aa  258  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  79.19 
 
 		 150 aa  239  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  85.35 
 
 		 158 aa  229  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  48.55 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  50.39 
 
 		 140 aa  140  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  50.35 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  47.29 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  45.6 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  46.77 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  45.59 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  44.06 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  43.94 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  45.04 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  40.74 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  40.74 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  41.98 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  46.56 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  48.44 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  47.06 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  46.58 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  48.74 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  45.04 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  47.45 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  39.23 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  45.38 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  43.7 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  45.45 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  45.65 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  44.37 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  53.39 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  44.09 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  42.28 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  44.54 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  46.15 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  42.19 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  44.55 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  37.82 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  33.59 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  26.32 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  35.58 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1640  hypothetical protein  25.42 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>