More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2640 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2640  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  82.9 
 
 
313 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  86.77 
 
 
310 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  87.1 
 
 
310 aa  501  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  87.74 
 
 
310 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  85.62 
 
 
310 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  87.1 
 
 
310 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  86.93 
 
 
310 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  86.6 
 
 
310 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2169  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  87.42 
 
 
310 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0328573  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  84.52 
 
 
310 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  82.26 
 
 
310 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  80.65 
 
 
308 aa  474  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2092  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  86.67 
 
 
315 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  80.65 
 
 
309 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4306  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  88.27 
 
 
310 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  82.58 
 
 
310 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  80.97 
 
 
310 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  80.97 
 
 
310 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.06 
 
 
309 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  80 
 
 
308 aa  461  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  80.97 
 
 
308 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  77.07 
 
 
314 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  74.76 
 
 
314 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.45 
 
 
311 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  78.18 
 
 
311 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  77.85 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.77 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.85 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.42 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.85 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.45 
 
 
311 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.13 
 
 
311 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  76.13 
 
 
311 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.13 
 
 
311 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.13 
 
 
311 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  75.81 
 
 
311 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.13 
 
 
311 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.13 
 
 
311 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.13 
 
 
311 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  75.16 
 
 
315 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.47 
 
 
310 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.22 
 
 
311 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  77.74 
 
 
311 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.19 
 
 
311 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1289  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  77.74 
 
 
311 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.398679  normal  0.0814706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.1 
 
 
309 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.1 
 
 
309 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  74.43 
 
 
314 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  71.1 
 
 
309 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  71.79 
 
 
327 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  71.2 
 
 
309 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.45 
 
 
309 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0738  electron transfer flavoprotein, subunit alpha  76.45 
 
 
311 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170682  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.06 
 
 
314 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0865  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.39 
 
 
311 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0314177  normal  0.611517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5518  electron transfer flavoprotein subunit alpha  76.55 
 
 
310 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  66.99 
 
 
310 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0794  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  79.03 
 
 
311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.516944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.45 
 
 
309 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2549  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  76.77 
 
 
311 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.95 
 
 
310 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.03 
 
 
309 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  71.52 
 
 
309 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0924  electron transfer flavoprotein subunit alpha  76.77 
 
 
311 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  67.97 
 
 
310 aa  395  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  68.71 
 
 
311 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.74 
 
 
309 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  70.13 
 
 
309 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.42 
 
 
309 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.42 
 
 
319 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.42 
 
 
309 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.42 
 
 
309 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.39 
 
 
309 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.55 
 
 
309 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4828  electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.23 
 
 
312 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.67 
 
 
308 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.99 
 
 
309 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.39 
 
 
313 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  70.59 
 
 
309 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  64.84 
 
 
314 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  71.1 
 
 
309 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.63 
 
 
314 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
309 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.97 
 
 
310 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.81 
 
 
309 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.68 
 
 
309 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.45 
 
 
349 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0422  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.84 
 
 
310 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  65.36 
 
 
309 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.63 
 
 
317 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.69 
 
 
309 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.05 
 
 
308 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3272  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.45 
 
 
311 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.01 
 
 
310 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.1 
 
 
310 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.96 
 
 
312 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.08 
 
 
307 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.1 
 
 
309 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  68.39 
 
 
314 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>