21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2529 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2529  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0850  hypothetical protein  45.61 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272158  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2656  hypothetical protein  42.11 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03903  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2943  hypothetical protein  42.37 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3212  hypothetical protein  38.6 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2070  hypothetical protein  54.35 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.981444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1147  hypothetical protein  44.44 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2334  hypothetical protein  45.61 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.777792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1451  hypothetical protein  47.27 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2902  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0615892  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1252  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1320  hypothetical protein  41.82 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  37.29 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2581  hypothetical protein  41.82 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2823  hypothetical protein  37.29 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2751  hypothetical protein  41.82 
 
 		 225 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3213  hypothetical protein  41.67 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.052023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0798  hypothetical protein  47.37 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.249703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0838  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.011638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1524  hypothetical protein  45.45 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>