229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2385 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  100 
 
 
492 aa  969    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  98.37 
 
 
517 aa  956    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  59.18 
 
 
497 aa  594  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  61.82 
 
 
503 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  62.13 
 
 
499 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  61.59 
 
 
503 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  61.99 
 
 
502 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  61.38 
 
 
503 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  62.73 
 
 
502 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  61.9 
 
 
502 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  63.16 
 
 
502 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  61.9 
 
 
502 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  63.16 
 
 
502 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  61.7 
 
 
502 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  60.16 
 
 
502 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  55.06 
 
 
494 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  59.11 
 
 
490 aa  531  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  57.2 
 
 
496 aa  521  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  54.05 
 
 
533 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  51.47 
 
 
507 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  48.79 
 
 
494 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  48.35 
 
 
489 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  49.18 
 
 
509 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  48.61 
 
 
532 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.48 
 
 
502 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  46.28 
 
 
524 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  45.44 
 
 
500 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  40.66 
 
 
515 aa  346  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.04 
 
 
505 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  39.84 
 
 
496 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  39.84 
 
 
496 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.04 
 
 
494 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.64 
 
 
500 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  40.78 
 
 
496 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  40.58 
 
 
496 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  37.06 
 
 
486 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.78 
 
 
485 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.34 
 
 
497 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.61 
 
 
503 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.69 
 
 
492 aa  259  9e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  36.5 
 
 
482 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.45 
 
 
479 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.95 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  34.9 
 
 
487 aa  252  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  34.9 
 
 
487 aa  252  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  35.97 
 
 
486 aa  251  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.13 
 
 
484 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1389  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.48 
 
 
530 aa  249  6e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.461228  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1431  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.62 
 
 
486 aa  249  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.22 
 
 
483 aa  246  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  35.45 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  33 
 
 
516 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.26 
 
 
514 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.26 
 
 
516 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.26 
 
 
516 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.99 
 
 
510 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  34.7 
 
 
517 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.26 
 
 
516 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  36.03 
 
 
483 aa  238  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  32.93 
 
 
510 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  36.73 
 
 
503 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.61 
 
 
494 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  32.2 
 
 
510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.25 
 
 
488 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.99 
 
 
483 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0729525 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  32.85 
 
 
527 aa  228  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.33 
 
 
493 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.52 
 
 
494 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  31.52 
 
 
494 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  31.52 
 
 
494 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.22 
 
 
486 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.34 
 
 
510 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  32.36 
 
 
483 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.75 
 
 
536 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  35.31 
 
 
485 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.69 
 
 
483 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.35 
 
 
494 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.58 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.16 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.59 
 
 
543 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.39 
 
 
518 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.39 
 
 
518 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.13 
 
 
514 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.71 
 
 
497 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.44 
 
 
499 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.06 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.27 
 
 
498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.61 
 
 
506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  31.68 
 
 
484 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.48 
 
 
510 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.48 
 
 
510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.48 
 
 
496 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.48 
 
 
534 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.48 
 
 
534 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.48 
 
 
496 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.48 
 
 
496 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.33 
 
 
496 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  31.75 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  34.31 
 
 
575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  31.46 
 
 
484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>