299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2194 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
159 aa  327  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  96.23 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  85.19 
 
 
162 aa  280  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  79.87 
 
 
157 aa  262  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  75.32 
 
 
158 aa  251  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  65.82 
 
 
151 aa  210  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  59.49 
 
 
194 aa  200  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  59.12 
 
 
164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  60.13 
 
 
151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  59.87 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  58.23 
 
 
155 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  60.76 
 
 
151 aa  193  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  55.35 
 
 
154 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  55.35 
 
 
154 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  55.48 
 
 
158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  59.06 
 
 
158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  56.77 
 
 
158 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  54.43 
 
 
151 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  51.9 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  56.29 
 
 
148 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  50.32 
 
 
150 aa  167  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  51.61 
 
 
153 aa  167  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  49.68 
 
 
156 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  55.06 
 
 
158 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 
151 aa  165  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  54.49 
 
 
151 aa  163  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  52.26 
 
 
150 aa  163  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  53.16 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  53.16 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  53.16 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  50.94 
 
 
150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  53.16 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  53.16 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  53.16 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  50 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  47.4 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  52.53 
 
 
160 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  53.16 
 
 
158 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  53.16 
 
 
158 aa  158  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  53.16 
 
 
158 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  53.16 
 
 
158 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  49.36 
 
 
150 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  53.16 
 
 
158 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  52.53 
 
 
158 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  51.27 
 
 
160 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  48.37 
 
 
151 aa  155  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  53.55 
 
 
152 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  48.72 
 
 
151 aa  154  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  47.47 
 
 
152 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  46.1 
 
 
152 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  50.68 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  50.63 
 
 
152 aa  151  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  49.68 
 
 
151 aa  151  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1606  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 
153 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00168031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  49.03 
 
 
150 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  50.66 
 
 
152 aa  148  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  47.77 
 
 
151 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
151 aa  148  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  47.4 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  49.02 
 
 
153 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  47.74 
 
 
153 aa  141  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  48.08 
 
 
150 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  50.33 
 
 
158 aa  140  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  49.65 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  43.95 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  44.3 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4112  Enoyl-CoA hydratase  43.31 
 
 
161 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0069293  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  44.85 
 
 
158 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  43.67 
 
 
151 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  46.15 
 
 
168 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  46.15 
 
 
151 aa  133  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  48.99 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  45.33 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  45.45 
 
 
154 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3008  dehydratase  43.14 
 
 
228 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026488  normal  0.774607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  48.32 
 
 
151 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  47.37 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  47.65 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  46.98 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  44.16 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  44.81 
 
 
163 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  46.05 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  46.62 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  46.62 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1788  MaoC domain-containing protein  45.14 
 
 
228 aa  127  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  48.2 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  46.98 
 
 
151 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  44.81 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
151 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  46.31 
 
 
151 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2877  MaoC domain protein dehydratase  47.06 
 
 
153 aa  124  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  42.68 
 
 
158 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  43.45 
 
 
152 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4259  MaoC domain protein dehydratase  40.4 
 
 
157 aa  124  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358063  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
160 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  42.86 
 
 
161 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>