More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2066 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  82.47 
 
 
97 aa  166  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  82.47 
 
 
97 aa  166  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  79.79 
 
 
96 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  74.47 
 
 
96 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  73.56 
 
 
96 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  75.9 
 
 
96 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  45.83 
 
 
97 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  45.83 
 
 
97 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  45.83 
 
 
97 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  45.83 
 
 
97 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  45.83 
 
 
97 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  45.83 
 
 
97 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  53.93 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  44.79 
 
 
97 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  44.79 
 
 
97 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  44.79 
 
 
97 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
94 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
94 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
94 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
94 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
94 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
94 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  47.25 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 
101 aa  87.4  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  52.08 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  52.08 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  46.32 
 
 
114 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  46.32 
 
 
114 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  46.32 
 
 
114 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  46.32 
 
 
114 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  46.32 
 
 
114 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  45.83 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  50 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  45.83 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  45.26 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  43.16 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3665  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0598755  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0561  transposase  37.23 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  48.94 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  48.94 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  48.94 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  48.94 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  48.94 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  48.94 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  48.94 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  48.39 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  48.39 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0282  ISMca2, transposase, OrfA  48 
 
 
120 aa  77  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0906  ISMca2, transposase, OrfA  47.52 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.252803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  46.94 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  51.06 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  40 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  40 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  40 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  41.24 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  42.55 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>