More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2035 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  100 
 
 		 224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  99.11 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  92.27 
 
 		 220 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  82.22 
 
 		 223 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  78.41 
 
 		 227 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  65.61 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  65.61 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  66.22 
 
 		 219 aa  278  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  65.92 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  65.16 
 
 		 219 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  65.92 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  66.2 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  61.86 
 
 		 216 aa  266  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  61.86 
 
 		 216 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  63.08 
 
 		 222 aa  265  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  66.82 
 
 		 219 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  61.4 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  65.47 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  65.47 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  65.47 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  65.47 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  65.47 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  65.47 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  65.47 
 
 		 220 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  61.54 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  65.77 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  60.19 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  53.65 
 
 		 226 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.85 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.44 
 
 		 215 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.13 
 
 		 216 aa  211  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  42.92 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  46.12 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  46.12 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  46.12 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  46.3 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  46.12 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  42.92 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  42.47 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  42.47 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  42.47 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.98 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  43.98 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  43.98 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  44.7 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  44.75 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  41.2 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  41.67 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  41.63 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  35.38 
 
 		 201 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  34.11 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  35.65 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.86 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.01 
 
 		 208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  34.27 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.48 
 
 		 210 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.08 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 217 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  29.91 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.02 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.02 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  30.37 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.42 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.42 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.37 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.37 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.37 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.37 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.37 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.37 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  31.8 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.35 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  35.35 
 
 		 204 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  35.35 
 
 		 204 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.03 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  35.35 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  32.88 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  40 
 
 		 194 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  40 
 
 		 194 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  40 
 
 		 194 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  40 
 
 		 194 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  30.37 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  30.84 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>