More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1992 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  93.43 
 
 		 274 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  86.13 
 
 		 274 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  69.14 
 
 		 274 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  69.03 
 
 		 271 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  61.48 
 
 		 277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  57.14 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  61.11 
 
 		 277 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  54.51 
 
 		 270 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  51.12 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  51.87 
 
 		 268 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  52.96 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  51.33 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  50.19 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  51.52 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  50.19 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 279 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  49.27 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  48.52 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  48.18 
 
 		 273 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  47.91 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  48.36 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  34.94 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.26 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30.26 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30.26 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30.26 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30.26 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30.26 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.62 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  22.75 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.52 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27.96 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.91 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.2 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.89 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.53 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.95 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.41 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.79 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.22 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  27.03 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>