188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1970 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 143 aa  294  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  91.61 
 
 		 143 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  76.55 
 
 		 146 aa  216  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  73.53 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  71.11 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  72.79 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  72.79 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  71.85 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  72.26 
 
 		 144 aa  190  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  71.85 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  71.85 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  71.85 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  71.85 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  71.85 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 132 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  72.18 
 
 		 134 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  71.85 
 
 		 134 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  69.63 
 
 		 137 aa  186  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 141 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  70.23 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  60.14 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  64.62 
 
 		 121 aa  166  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  58.55 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  62.96 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  90 
 
 		 157 aa  159  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  91.14 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  59.42 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 140 aa  157  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 161 aa  155  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  84.15 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  81.25 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  84.42 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  84.42 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  77.11 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  83.12 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  75.86 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  83.12 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  57.81 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  55.65 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  83.12 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  75.86 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  79.49 
 
 		 118 aa  137  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  75.86 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  79.22 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  73.03 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  70.45 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  69.14 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  69.14 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  75.64 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  74.03 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  51.18 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  51.18 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  47.25 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 281 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 757 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0267  MerR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0912  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 840 aa  81.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  49.4 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 272 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1782  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  40.62 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  39.39 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  39.67 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1864  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0288491  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  50.7 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2688  regulatory protein, MerR  49.33 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>