More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1842 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  94.74 
 
 		 456 aa  838    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 456 aa  918    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  70.31 
 
 		 465 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  70.52 
 
 		 465 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  70.52 
 
 		 465 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  69.3 
 
 		 466 aa  621  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  62.11 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  60.26 
 
 		 463 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  56.96 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  57.89 
 
 		 461 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.02 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 462 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  43.04 
 
 		 463 aa  358  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.65 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 445 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 449 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 		 467 aa  319  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.05 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 467 aa  303  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 477 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 469 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  39.18 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  35.01 
 
 		 482 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  35.64 
 
 		 482 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  35.85 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  35.79 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  34.8 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  34.8 
 
 		 482 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 473 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  38.46 
 
 		 431 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  38.29 
 
 		 455 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  34.68 
 
 		 475 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  38.78 
 
 		 443 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  34.27 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  38.18 
 
 		 443 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  37.03 
 
 		 459 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  34.72 
 
 		 491 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  34.87 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  33.26 
 
 		 491 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  33.92 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 480 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 466 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 462 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 480 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  34.44 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 472 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 472 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 472 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  43.06 
 
 		 472 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 493 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 486 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.19 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.84 
 
 		 469 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 460 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  33.26 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  31.82 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  37.46 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  38.41 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  38.51 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  32.07 
 
 		 484 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  39.87 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  37.78 
 
 		 471 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  37.85 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 447 aa  209  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  38.87 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 489 aa  207  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 470 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  30.72 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 482 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.9 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  31.53 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>