117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1839 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  92.77 
 
 		 421 aa  799    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  100 
 
 		 429 aa  867    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  76.38 
 
 		 495 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1778  copper resistance B precursor  80.94 
 
 		 332 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104151  normal  0.145157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1720  copper resistance B precursor  79.93 
 
 		 324 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.099384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0657  copper resistance protein B  72.45 
 
 		 346 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5337  copper resistance B precursor  79.55 
 
 		 324 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5670  copper resistance protein B  73.65 
 
 		 360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2488  copper resistance B precursor  68.35 
 
 		 337 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2339  copper resistance B precursor  64.53 
 
 		 343 aa  349  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1234  copper resistance B precursor  63.32 
 
 		 326 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0449  copper resistance B precursor  63.32 
 
 		 326 aa  345  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1325  copper resistance protein B  57.99 
 
 		 288 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3256  copper resistance B precursor  53 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.22863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1946  putative copper resistance protein B  50.93 
 
 		 287 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.300672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3232  copper resistance protein B  41.64 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0013  copper resistance B precursor  43.22 
 
 		 371 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.001908  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0015  copper resistance B precursor  43.22 
 
 		 371 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0966383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0013  copper resistance B precursor  43.22 
 
 		 371 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37810  copper resistance protein B precursor  43.2 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0815776  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5182  copper resistance B precursor  41.06 
 
 		 371 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5379  copper resistance B precursor  42.25 
 
 		 369 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.486591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1494  copper resistance B precursor  44.76 
 
 		 312 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1267  copper resistance B precursor  50 
 
 		 303 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00955945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2217  copper resistance B precursor  39.7 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0429936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0573  copper resistance B precursor  43.46 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.972949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3811  copper resistance B precursor  42.51 
 
 		 301 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  0.848683 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5375  copper resistance B precursor  48.83 
 
 		 306 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1712  copper resistance B precursor  43.23 
 
 		 288 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0273  copper resistance B precursor  50 
 
 		 274 aa  209  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3106  copper resistance B precursor  38.18 
 
 		 341 aa  209  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1482  copper resistance B precursor  48.36 
 
 		 272 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000648661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1970  copper resistance B precursor  46.92 
 
 		 237 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4288  copper resistance B precursor  46.92 
 
 		 237 aa  203  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.28688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0250  copper resistance B precursor  46.92 
 
 		 237 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3545  copper resistance B precursor  46.23 
 
 		 237 aa  203  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0320075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3915  copper resistance protein B  41.06 
 
 		 258 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2457  copper resistance B precursor  42.36 
 
 		 323 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379097  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1570  copper resistance B precursor  44.61 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.729928  normal  0.0120943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0202  copper resistance B precursor  48.04 
 
 		 260 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03131  copper resistance protein B  35 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3415  copper resistance B precursor  45.85 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2930  copper resistance B precursor  35.22 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00270  Copper resistance B precursor  37.42 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2421  copper resistance B precursor  33.96 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1827  copper resistance B precursor  36.11 
 
 		 291 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2204  copper resistance protein B, putative  43.41 
 
 		 294 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2205  copper resistance B precursor  46.08 
 
 		 262 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0711  copper resistance B precursor  35.56 
 
 		 354 aa  169  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2351  copper resistance B precursor  41.21 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2220  copper resistance B precursor  41.18 
 
 		 341 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205984  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1708  copper resistance B precursor  41.04 
 
 		 237 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00160337  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  35.03 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0381  copper resistance B precursor  37.16 
 
 		 353 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1574  copper resistance B precursor  44.39 
 
 		 235 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2115  copper resistance B precursor  43.85 
 
 		 235 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2135  copper resistance B precursor  38.59 
 
 		 351 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2630  copper resistance B precursor  38.12 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0189  putative copper resistance protein CopB precursor  38.39 
 
 		 260 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  52.63 
 
 		 669 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1376  copper resistance B precursor  37.85 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4396  copper resistance B precursor  36.06 
 
 		 256 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0785  copper resistance B precursor  35.24 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.969863  normal  0.401852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2491  copper resistance B precursor  36.41 
 
 		 305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0093  copper resistance B precursor  34.78 
 
 		 314 aa  147  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3622  copper resistance B precursor  35.94 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  53.16 
 
 		 671 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  53.16 
 
 		 652 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  53.16 
 
 		 652 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00404  hypothetical protein  36.62 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4266  copper resistance B precursor  41.75 
 
 		 249 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  decreased coverage  0.00992965 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0109  copper resistance protein B precursor  38.92 
 
 		 289 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0721  hypothetical protein  43.42 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.353203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0347  copper resistance B precursor  32.07 
 
 		 236 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1590  copper-resistance protein CopB  32.67 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0127  copper resistance B precursor  35.83 
 
 		 246 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  66.18 
 
 		 619 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  59.26 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13439  predicted protein  35 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  75 
 
 		 604 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44134  predicted protein  29.71 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  68.25 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11472  predicted protein  31.43 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.408612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  55.7 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1821 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0014  hypothetical protein  62.75 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00739134  normal  0.0662412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0014  hypothetical protein  62.75 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0016  hypothetical protein  62.75 
 
 		 107 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.157597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5181  hypothetical protein  51.39 
 
 		 107 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.385313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  35.19 
 
 		 941 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  29.2 
 
 		 1569 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1064 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34245  predicted protein  31.96 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  51.28 
 
 		 672 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  41.67 
 
 		 539 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  27.01 
 
 		 1034 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  38.82 
 
 		 580 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  42.59 
 
 		 657 aa  53.1  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  40.86 
 
 		 569 aa  53.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  39.56 
 
 		 589 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>