More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1785 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 
90 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  80.22 
 
 
91 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  80.22 
 
 
91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  87.14 
 
 
91 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  75.64 
 
 
91 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  76.92 
 
 
91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  69.57 
 
 
92 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  78.02 
 
 
91 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  78.02 
 
 
91 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  78.02 
 
 
91 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  78.02 
 
 
91 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  78.02 
 
 
91 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  78.02 
 
 
91 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  62.92 
 
 
98 aa  120  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  76.92 
 
 
91 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  74.73 
 
 
91 aa  116  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  74.73 
 
 
91 aa  116  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  65.17 
 
 
94 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  75.71 
 
 
95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  75.71 
 
 
95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  58.7 
 
 
98 aa  106  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  68.06 
 
 
100 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  55.06 
 
 
94 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  60.67 
 
 
94 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  54.88 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  65.71 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  62.16 
 
 
91 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  54.35 
 
 
95 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  61.33 
 
 
91 aa  93.6  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  55.41 
 
 
94 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  56.58 
 
 
99 aa  84.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  54.29 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  48.89 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  47.78 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  47.78 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  44.68 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  47.83 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  43.02 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  43.02 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  43.02 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  38.89 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  41.86 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  43.66 
 
 
209 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  45.45 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  40.62 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  37.14 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  42.86 
 
 
833 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  40.62 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.75 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  45.31 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  52.31 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  44.07 
 
 
61 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  39.39 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  39.73 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  37.14 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  39.39 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  39.33 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  41.27 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  42.19 
 
 
74 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
823 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
699 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 
838 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  43.75 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  43.84 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
818 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  46.88 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2788  heavy metal transport/detoxification protein  39.08 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.863319  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2871  heavy metal transport/detoxification protein  42.47 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 
938 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  38.24 
 
 
954 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  36.92 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  39.06 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
885 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1407  mercuric transport periplasmic protein MerP, putative  41.1 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
759 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
942 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 
69 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  36.07 
 
 
68 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
836 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
762 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
737 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 
199 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
196 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
816 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
758 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  35.38 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
737 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  42.62 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
837 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
890 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
821 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
871 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
1071 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>