More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1751 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
373 aa  753    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  100 
 
 
373 aa  753    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  70.03 
 
 
367 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  55.45 
 
 
319 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  51.63 
 
 
346 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  53.63 
 
 
347 aa  345  8e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  53.82 
 
 
348 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  51.4 
 
 
383 aa  338  7e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  53.16 
 
 
335 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  53.97 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  54.3 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  51.09 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  52.44 
 
 
339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  53.42 
 
 
350 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  53.69 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  53.69 
 
 
320 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  50.83 
 
 
330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  50.5 
 
 
330 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  48.16 
 
 
341 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.67 
 
 
332 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  48 
 
 
339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  51.49 
 
 
340 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  49.67 
 
 
319 aa  311  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  51.33 
 
 
338 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  50.66 
 
 
342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  45.6 
 
 
324 aa  309  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  47.9 
 
 
331 aa  309  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  47.16 
 
 
343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  49.16 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  50.67 
 
 
357 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  50.33 
 
 
358 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  47.38 
 
 
340 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  44.77 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.33 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.33 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.33 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  49.85 
 
 
334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  48.36 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  46.03 
 
 
319 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  50.65 
 
 
324 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  50.33 
 
 
347 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  50.33 
 
 
347 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  50 
 
 
353 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  48.51 
 
 
360 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  47.21 
 
 
311 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  47.21 
 
 
311 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.82 
 
 
323 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  44.82 
 
 
323 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  45.75 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  44.82 
 
 
323 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.82 
 
 
323 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  48.25 
 
 
324 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  48 
 
 
365 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  48 
 
 
365 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  44.88 
 
 
312 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  48.5 
 
 
335 aa  295  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  44.48 
 
 
323 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  51 
 
 
348 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  50.67 
 
 
347 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  48.39 
 
 
332 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  50.67 
 
 
347 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  50.67 
 
 
347 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 
320 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  47.65 
 
 
347 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  49.67 
 
 
327 aa  292  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  47.67 
 
 
365 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 
310 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  47.17 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  43.89 
 
 
336 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  47.51 
 
 
306 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
327 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  49.35 
 
 
339 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  48.49 
 
 
345 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  45.54 
 
 
308 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  46.51 
 
 
306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  45.21 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  44.97 
 
 
322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  44.16 
 
 
364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  45.21 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  45.85 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  43.59 
 
 
366 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  43.19 
 
 
321 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  46.79 
 
 
319 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.09 
 
 
319 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  45.85 
 
 
310 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  45.51 
 
 
310 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4719  glycosyl transferase family protein  46.13 
 
 
346 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.19129  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  47.32 
 
 
312 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  45.48 
 
 
319 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  49.67 
 
 
337 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 
320 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0123  Ribonuclease III  44.83 
 
 
350 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  43.69 
 
 
319 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  40.46 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  44.94 
 
 
363 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  43.38 
 
 
312 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  45.39 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 
339 aa  268  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>