More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1653 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  52.73 
 
 
821 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  51.27 
 
 
798 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  83.29 
 
 
814 aa  1277    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
817 aa  1652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  81.63 
 
 
804 aa  1242    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  50.38 
 
 
815 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  52.55 
 
 
797 aa  645    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  51.53 
 
 
803 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
743 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  52.67 
 
 
817 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
817 aa  1652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  51.43 
 
 
797 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  44.49 
 
 
795 aa  620  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  50.63 
 
 
802 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  50.63 
 
 
802 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
796 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  48.83 
 
 
805 aa  612  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  47.63 
 
 
753 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
815 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
823 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 
815 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 
815 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  48.26 
 
 
759 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  48.52 
 
 
857 aa  608  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  48.26 
 
 
759 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
1020 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 
818 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  42.55 
 
 
801 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  48.19 
 
 
799 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  46.84 
 
 
794 aa  602  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  46.72 
 
 
818 aa  600  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 
798 aa  602  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  42.77 
 
 
788 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  44.04 
 
 
806 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 
798 aa  602  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  46.79 
 
 
814 aa  597  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  44.16 
 
 
786 aa  598  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  44.67 
 
 
828 aa  595  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  43.95 
 
 
828 aa  593  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  44.22 
 
 
809 aa  594  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  48.83 
 
 
805 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  48.83 
 
 
805 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  48.67 
 
 
806 aa  593  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  48.83 
 
 
805 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
796 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  48.83 
 
 
805 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  44.42 
 
 
787 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  48.83 
 
 
806 aa  595  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 
758 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  52.04 
 
 
837 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  41.49 
 
 
787 aa  593  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  48.67 
 
 
805 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  48.36 
 
 
806 aa  591  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  48.25 
 
 
752 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  48.67 
 
 
805 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
889 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  47.76 
 
 
836 aa  588  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  44.83 
 
 
828 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.31 
 
 
954 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.02 
 
 
831 aa  586  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  44.91 
 
 
889 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  42.07 
 
 
786 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  50.74 
 
 
792 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  46.61 
 
 
794 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
793 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  43.47 
 
 
755 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
837 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  45.69 
 
 
942 aa  582  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  43 
 
 
804 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.04 
 
 
750 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  42.05 
 
 
773 aa  582  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  40.95 
 
 
801 aa  582  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  46.96 
 
 
866 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  47.68 
 
 
782 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
783 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  49.92 
 
 
793 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
885 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  41.78 
 
 
737 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
846 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
827 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  46.85 
 
 
851 aa  569  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  41.18 
 
 
767 aa  571  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
810 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
758 aa  571  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  51.5 
 
 
849 aa  569  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  41.41 
 
 
973 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  47.57 
 
 
844 aa  569  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 
895 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  40.86 
 
 
809 aa  568  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  42.75 
 
 
765 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  46.96 
 
 
894 aa  568  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
781 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  47.89 
 
 
826 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  46.17 
 
 
740 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
781 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  46.17 
 
 
742 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  45.93 
 
 
759 aa  562  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  48.54 
 
 
837 aa  565  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  47.47 
 
 
747 aa  561  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 
839 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>