51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1551 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  100 
 
 		 358 aa  746    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  100 
 
 		 358 aa  746    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  63.69 
 
 		 355 aa  474  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  35.44 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.45 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  29.52 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  30.06 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  30.45 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  29.46 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  28.61 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.79 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  30.09 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6543  hypothetical protein  28.18 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  29.02 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  29.66 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  31.49 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  29.49 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  43.42 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  37.62 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.15 
 
 		 681 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.15 
 
 		 678 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.15 
 
 		 681 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.34 
 
 		 899 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  49.06 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  49.06 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  49.06 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  26.81 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  43.55 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  28.83 
 
 		 220 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  25.62 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  41.94 
 
 		 777 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  29.69 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  30 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  28.46 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  35.37 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  28.51 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  51.22 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  51.22 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  50.98 
 
 		 890 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  50.98 
 
 		 890 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  46.15 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  47.27 
 
 		 895 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  30.83 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  25.22 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  27.03 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0613  putative DNA primase  26.51 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  36.59 
 
 		 878 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  29.79 
 
 		 847 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 929 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>