66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1518 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1275    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1275    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  71.73 
 
 		 622 aa  945    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  71.5 
 
 		 622 aa  911    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  68.6 
 
 		 622 aa  902    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  39.38 
 
 		 637 aa  439  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  37.01 
 
 		 635 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  32.48 
 
 		 621 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  37.36 
 
 		 629 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  34.63 
 
 		 635 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  31.74 
 
 		 615 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  34.26 
 
 		 635 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 633 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  32.34 
 
 		 629 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  32.32 
 
 		 704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  30.78 
 
 		 650 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  32.01 
 
 		 704 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  32.01 
 
 		 730 aa  270  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  30.34 
 
 		 743 aa  264  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  30.78 
 
 		 703 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  30.79 
 
 		 706 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  31.88 
 
 		 701 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  31.55 
 
 		 635 aa  257  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  30.24 
 
 		 664 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  30.41 
 
 		 718 aa  256  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  29.17 
 
 		 743 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  29.92 
 
 		 719 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  29.91 
 
 		 730 aa  252  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  31.75 
 
 		 707 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  29.39 
 
 		 719 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  29.13 
 
 		 744 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  30.61 
 
 		 719 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  30.66 
 
 		 708 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  30.02 
 
 		 718 aa  248  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  30.09 
 
 		 727 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  29.95 
 
 		 718 aa  248  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  29.4 
 
 		 719 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  29.6 
 
 		 733 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  30.15 
 
 		 721 aa  244  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  29.33 
 
 		 730 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  29.33 
 
 		 730 aa  243  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  27.87 
 
 		 624 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  28.86 
 
 		 729 aa  243  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  28.46 
 
 		 728 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  29.35 
 
 		 708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  26.66 
 
 		 752 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  28.09 
 
 		 659 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  27.87 
 
 		 644 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  26.6 
 
 		 668 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  35.16 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  30.56 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.26 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.97 
 
 		 455 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.93 
 
 		 589 aa  52  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6487  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  20.84 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5397  hypothetical protein  31.15 
 
 		 562 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  20.49 
 
 		 464 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6100  conjugal transfer coupling protein TraG  31.97 
 
 		 663 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5456  transfer complex protein TrsK-like protein  25 
 
 		 638 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5695  transfer complex protein TrsK-like protein  25 
 
 		 638 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.604846 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5572  conjugal transfer coupling protein TraG  27.87 
 
 		 674 aa  45.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0224305  normal  0.0294254 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  25.83 
 
 		 786 aa  45.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  25.83 
 
 		 657 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2469  transfer complex protein TrsK-like protein  25.41 
 
 		 569 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0805174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3886  transfer complex protein TrsK-like protein  25.41 
 
 		 569 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>