78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1150 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  100 
 
 		 388 aa  787    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  70.4 
 
 		 388 aa  524  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  66.15 
 
 		 390 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  54.77 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  52.04 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  52.04 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  51.79 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  49.86 
 
 		 515 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  49.86 
 
 		 465 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  49.86 
 
 		 515 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  49.86 
 
 		 515 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  49.86 
 
 		 515 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  49.86 
 
 		 515 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  48.27 
 
 		 380 aa  335  7e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  45.08 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  47.7 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  47.7 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.72 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  38.03 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  39.28 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  35.1 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  33.33 
 
 		 400 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  33.33 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.41 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000174654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.33 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.33 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.95 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.72 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  33.42 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  31.22 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  30.79 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.57 
 
 		 411 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.92 
 
 		 432 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.05 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.02 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  28.38 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  27.25 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  28.53 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  29.48 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.42 
 
 		 448 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  27.85 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000139035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  27.53 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  27.85 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000109995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  27.85 
 
 		 382 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  29.78 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  27.48 
 
 		 569 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  29.2 
 
 		 611 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  28.32 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  28.32 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.2 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.2 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  28.33 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.82 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  26.58 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  26.55 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  30.37 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  30.37 
 
 		 652 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  27.87 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.05 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.49 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.39 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  28.12 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.37 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.37 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  26.44 
 
 		 585 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.58 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.08 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  24.66 
 
 		 590 aa  82.8  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.32 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  23.74 
 
 		 579 aa  79.7  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  25.91 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.93 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  26.22 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  23.39 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>