More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1074 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  96.79 
 
 		 249 aa  477  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  90.16 
 
 		 246 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  69.75 
 
 		 244 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  70.09 
 
 		 260 aa  350  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  56.02 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  56.22 
 
 		 284 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  54.29 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  54.29 
 
 		 260 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  54.55 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  49.19 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  50.66 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  54.11 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  52.81 
 
 		 243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  50.2 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  54.2 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  50.44 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  47.35 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  51.3 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  49.12 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  53.04 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  44.53 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  45.83 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  46.94 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  47.86 
 
 		 249 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  48.74 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  45.16 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 256 aa  205  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 262 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  46.98 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  47.64 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.66 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  43.78 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  44.35 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  48.46 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  43.91 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  47.16 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  46.78 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  46.78 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  46.55 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  44.8 
 
 		 259 aa  181  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  41.41 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  45.69 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  46.55 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  42.73 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  41.98 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  46.4 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  43.58 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  42.53 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  38.96 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  39.11 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  43.53 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  41.23 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  44.23 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  38.36 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  42.17 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  46.09 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  43 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  42.22 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  40.73 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  43.23 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  42.19 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  42.33 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  41.92 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  44.6 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  44.3 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  39.57 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  43.12 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  41.1 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  38.43 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  38.03 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  38.71 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  41.52 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  44.55 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  39.25 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  37.07 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  41.63 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  39.92 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  44.44 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  38.78 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  40.18 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  42.02 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  43.48 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  40.87 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  43.1 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  43.48 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  40.61 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  43.48 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  39.32 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  40.32 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  34.01 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  37.71 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  37.71 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>