More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1049 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1049  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
314 aa  613  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1141  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  97.45 
 
 
314 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1205  hypothetical protein  84.74 
 
 
321 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2097  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  63.64 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2117  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  62.73 
 
 
302 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391815  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1733  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.66 
 
 
315 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0943473  normal  0.0857588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1451  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  66.52 
 
 
309 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6257  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.06 
 
 
310 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0810528  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1822  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.06 
 
 
310 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1846  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.06 
 
 
310 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2352  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O- methyltransferase  55.12 
 
 
319 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.030137  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5123  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  54.06 
 
 
310 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354756  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1835  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.74 
 
 
350 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.20732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1760  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  64.47 
 
 
310 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.916333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1356  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.55 
 
 
322 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1846  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.55 
 
 
322 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1118  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.55 
 
 
331 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2200  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.24 
 
 
322 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.55 
 
 
322 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2367  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.24 
 
 
322 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2238  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.24 
 
 
322 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.33511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2224  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  64.71 
 
 
327 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  60.17 
 
 
327 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1298  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  65.12 
 
 
218 aa  278  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.075528  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0656  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  63.26 
 
 
218 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.861145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3016  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.47 
 
 
215 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5028  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.91 
 
 
247 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1825  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.34 
 
 
223 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.175242  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1798  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.31 
 
 
257 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1253  L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48.76 
 
 
269 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1161  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.55 
 
 
256 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.2079  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1081  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.09 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0517019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2523  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  54.3 
 
 
216 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284795  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.56 
 
 
252 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0836  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  55.66 
 
 
226 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214261  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1415  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.36 
 
 
261 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1921  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.75 
 
 
283 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.176925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38700  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.8 
 
 
226 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.12 
 
 
218 aa  206  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.45 
 
 
225 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12772  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2578  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.7 
 
 
287 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.076935  hitchhiker  0.00124111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.78 
 
 
222 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3023  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.91 
 
 
224 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.32 
 
 
211 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.55 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1563  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.87 
 
 
211 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
225 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491382  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4156  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.45 
 
 
224 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1175  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.45 
 
 
224 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334554  normal  0.339213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1621  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.45 
 
 
231 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4054  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.617904  hitchhiker  0.00000246992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0089  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.34 
 
 
255 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2781  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.91 
 
 
264 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.864043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2634  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.98 
 
 
229 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2419  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.55 
 
 
219 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.9 
 
 
220 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.68 
 
 
221 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0496  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.49 
 
 
211 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1287  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.67 
 
 
221 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.17 
 
 
211 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.03 
 
 
213 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.745112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.34 
 
 
216 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1250  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.06 
 
 
223 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.424545 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.42 
 
 
208 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1459  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.98 
 
 
225 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.61 
 
 
215 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1256  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45 
 
 
232 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.87 
 
 
208 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.87 
 
 
208 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.87 
 
 
208 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00164  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.95 
 
 
225 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0650575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.67 
 
 
211 aa  176  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0547  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.13 
 
 
259 aa  175  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.25 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.23 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.968624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1192  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.23 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.23 
 
 
211 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
211 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.75 
 
 
208 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.61 
 
 
208 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
211 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
211 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
211 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1076  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.05 
 
 
216 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3344  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.57 
 
 
211 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110739  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1058  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
211 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1919  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.74 
 
 
225 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.837211  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09538  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
213 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.41 
 
 
216 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3434  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.29 
 
 
211 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.04 
 
 
216 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.44 
 
 
208 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1313  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.74 
 
 
197 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000117774  decreased coverage  0.000182851 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52 
 
 
232 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0135  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.48 
 
 
206 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.5 
 
 
206 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1993  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  43.89 
 
 
210 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.62 
 
 
206 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.95 
 
 
208 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.99 
 
 
208 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>