170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0989 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0989  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 261 aa  534  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183527  normal  0.269998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1085  beta-lactamase domain protein  98.47 
 
 		 261 aa  524  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1147  hypothetical protein  83.52 
 
 		 261 aa  441  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.385681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1070  beta-lactamase-like protein  70.66 
 
 		 262 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1106  Beta-lactamase-like  69.11 
 
 		 262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1425  beta-lactamase domain-containing protein  59.39 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101426  normal  0.203136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2546  beta-lactamase domain protein  58.62 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102753  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1587  putative metallo-beta-lactamase family protein  58.62 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2111  beta-lactamase domain-containing protein  57.75 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.234002  hitchhiker  0.00376892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2130  beta-lactamase domain-containing protein  57.47 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163194  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2003  beta-lactamase domain-containing protein  57.47 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.645635  hitchhiker  0.0000000218152 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5984  beta-lactamase-like  57.36 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2093  beta-lactamase domain-containing protein  57.36 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5399  Beta-lactamase-like  56.2 
 
 		 258 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00646528  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1181  beta-lactamase domain-containing protein  57.81 
 
 		 258 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0988621  hitchhiker  0.00000250799 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3139  metallo-beta-lactamase family protein  57.85 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.904093  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1676  metallo-beta-lactamase family protein  57.47 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2696  metallo-beta-lactamase family protein  57.47 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2178  metallo-beta-lactamase family protein  57.47 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0850031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2617  metallo-beta-lactamase family protein  57.47 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1451  metallo-beta-lactamase family protein  57.47 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1908  metallo-beta-lactamase family protein  57.85 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.952512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2563  metallo-beta-lactamase family protein  58.14 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0841  beta-lactamase-like protein  49.62 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000232036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0985  beta-lactamase-like protein  49.62 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000377257  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0848  Beta-lactamase-like  53.52 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.701692  hitchhiker  0.00132369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0829  beta-lactamase domain protein  53.12 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3434  beta-lactamase domain protein  51.74 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1139  Beta-lactamase-like  50.39 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000269692  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1100  hypothetical protein  52.51 
 
 		 252 aa  248  8e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.947825  normal  0.67239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3172  beta-lactamase-like  49.43 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1335  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2565  hypothetical protein  52.51 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1008  beta-lactamase domain-containing protein  47.86 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0922  beta-lactamase domain protein  48.06 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2814  beta-lactamase-like protein  44.79 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0408  hypothetical protein  44.53 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1194  beta-lactamase domain-containing protein  47.89 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  44.19 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3973  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1373  Beta-lactamase-like  43.58 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3951  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.75 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00829584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1550  Beta-lactamase-like  43.75 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1239  beta-lactamase domain protein  42.58 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.668505  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4179  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1269  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.914297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4385  hypothetical protein  43.78 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2313  beta-lactamase domain-containing protein  38.36 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00657637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2327  beta-lactamase-like protein  36.99 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000211578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2620  beta-lactamase-like  39.46 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20260  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1236  beta-lactamase domain-containing protein  40.17 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3388  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3027  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4002  beta-lactamase domain-containing protein  38.17 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2063  beta-lactamase domain-containing protein  38.63 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2799  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00920301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1329  beta-lactamase superfamily hydrolase  38.4 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1895  beta-lactamase domain-containing protein  41.41 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2153  beta-lactamase domain-containing protein  39.74 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2782  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.492368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2693  beta-lactamase domain protein  38.77 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.552657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1631  metallo-beta-lactamase family protein  38.56 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0446531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1944  Beta-lactamase-like  38.74 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4326  beta-lactamase-like  38.03 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.111759  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3405  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0745  beta-lactamase domain protein  39.48 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2932  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2615  metallo-beta-lactamase family protein  32.65 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3534  beta-lactamase domain protein  36.48 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2918  beta-lactamase domain protein  41.77 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5255  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5350  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000218111  hitchhiker  0.00000000000000228298 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5585  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5611  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5646  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0604366  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0232  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5315  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5143  zinc-dependent hydrolase  34.84 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5159  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5568  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.62183e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5711  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1144  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2334  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.577131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1886  beta-lactamase domain protein  38.26 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1050  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0631  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4916  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0648  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2896  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2443  hypothetical protein  34.32 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4997  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101352  normal  0.026675 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0022  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0022  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3811  beta-lactamase domain-containing protein  36.82 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0438  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 		 252 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.2 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2530  metallo-beta-lactamase family protein YycJ  29.07 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.22966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0105  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.590593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07370  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily I  35.19 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.118565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>