More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0846 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  94.44 
 
 
406 aa  774    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  99.75 
 
 
396 aa  810    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
396 aa  811    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  74.54 
 
 
404 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  74.93 
 
 
394 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  66.75 
 
 
393 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  66.58 
 
 
417 aa  541  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  66.4 
 
 
393 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  66.14 
 
 
393 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  66.14 
 
 
393 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  66.14 
 
 
393 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  65.88 
 
 
393 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  66.14 
 
 
393 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  66.14 
 
 
393 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  65.03 
 
 
398 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  65.09 
 
 
393 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  65.03 
 
 
398 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  64.77 
 
 
398 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  66.4 
 
 
393 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  66.4 
 
 
393 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  66.4 
 
 
393 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  66.4 
 
 
393 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  66.4 
 
 
393 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  66.4 
 
 
393 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  53.05 
 
 
407 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  56.28 
 
 
406 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  54.79 
 
 
426 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  55.01 
 
 
406 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
450 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  53.3 
 
 
398 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  48.78 
 
 
420 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  54.11 
 
 
416 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  52.06 
 
 
402 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  54.81 
 
 
426 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  50.76 
 
 
406 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
383 aa  363  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  46.17 
 
 
397 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
396 aa  349  6e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 
401 aa  347  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  46.21 
 
 
394 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
395 aa  335  9e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 
395 aa  334  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  43 
 
 
397 aa  332  8e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  47.55 
 
 
395 aa  332  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
405 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  43.04 
 
 
400 aa  330  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  42.97 
 
 
397 aa  322  8e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  45.29 
 
 
394 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.24 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 
399 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 
388 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  41.69 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  41 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  42.01 
 
 
408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 
403 aa  305  9.000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  40.95 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  40.95 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  39.39 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  38.78 
 
 
446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 
437 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
410 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  43.83 
 
 
377 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 
438 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 
395 aa  301  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  42.36 
 
 
404 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  38.85 
 
 
440 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  38.99 
 
 
435 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  40.35 
 
 
441 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  46.3 
 
 
400 aa  297  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  42.19 
 
 
399 aa  295  8e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  39.65 
 
 
406 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 
441 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  38.52 
 
 
433 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
416 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
399 aa  292  8e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  38.12 
 
 
437 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 
463 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
397 aa  288  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
397 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  39.03 
 
 
611 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  45.9 
 
 
402 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  43.18 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 
409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.36 
 
 
436 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 
430 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
437 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 
401 aa  281  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
386 aa  281  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 
438 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 
439 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
391 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  42.09 
 
 
340 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>