255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0752 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  94.64 
 
 
261 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  83.91 
 
 
261 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  74.05 
 
 
257 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  74.71 
 
 
258 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  73.56 
 
 
258 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  73.56 
 
 
258 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  74.9 
 
 
259 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  74.43 
 
 
257 aa  361  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  74.43 
 
 
257 aa  361  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  73.56 
 
 
258 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  72.14 
 
 
257 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  75.19 
 
 
257 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  69.96 
 
 
258 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  50.4 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  50.61 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  51.61 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  50 
 
 
258 aa  238  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  49 
 
 
256 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  48.61 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  48.11 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  49.22 
 
 
282 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  46.04 
 
 
260 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  48.37 
 
 
250 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  50.2 
 
 
256 aa  228  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  48.99 
 
 
250 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  50.2 
 
 
255 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  48.99 
 
 
331 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  48.99 
 
 
322 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  49.8 
 
 
255 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  49.8 
 
 
255 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  49.22 
 
 
263 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  48.19 
 
 
252 aa  222  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  47.22 
 
 
259 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  48.19 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  47.41 
 
 
257 aa  221  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  47.22 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  47.06 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  46.43 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  48.59 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  49.8 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  47.81 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  47.66 
 
 
251 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  46.83 
 
 
259 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  46.56 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  50 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  43.63 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  48 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  45.63 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  43.37 
 
 
256 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  51.6 
 
 
271 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  46.99 
 
 
261 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  48.52 
 
 
271 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  45.6 
 
 
262 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  45.38 
 
 
255 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  45.1 
 
 
259 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  46.96 
 
 
251 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  44.98 
 
 
255 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  43.54 
 
 
264 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  43.6 
 
 
262 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  46.58 
 
 
237 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  43.32 
 
 
266 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  46.51 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  42.86 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  44.53 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  45.42 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  48.4 
 
 
257 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  47.01 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  44.86 
 
 
255 aa  198  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  44.62 
 
 
263 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  48.21 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  48.62 
 
 
264 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  43.6 
 
 
257 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  44.22 
 
 
258 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  44.84 
 
 
258 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  44.84 
 
 
258 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  44.22 
 
 
263 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  43.2 
 
 
257 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  44.84 
 
 
258 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  43.6 
 
 
257 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  43.6 
 
 
257 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  43.6 
 
 
257 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  44.44 
 
 
258 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  44.44 
 
 
258 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  43.2 
 
 
257 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  44.44 
 
 
258 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  44.44 
 
 
258 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  40.48 
 
 
265 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  48.58 
 
 
271 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  42.8 
 
 
257 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  38.95 
 
 
277 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  37.45 
 
 
254 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  40.21 
 
 
274 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  38.58 
 
 
254 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  37.45 
 
 
256 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4246  class II aldolase/adducin family protein  44.67 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  39.5 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  45.9 
 
 
265 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  37.12 
 
 
236 aa  159  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  34.62 
 
 
244 aa  145  5e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>