166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0710 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  94.26 
 
 		 209 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  90.43 
 
 		 209 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  71.98 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  71.5 
 
 		 213 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  71.5 
 
 		 213 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  71.5 
 
 		 213 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  71.5 
 
 		 213 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  73.08 
 
 		 219 aa  299  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  71.5 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  71.01 
 
 		 255 aa  297  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  70.53 
 
 		 242 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  71.5 
 
 		 213 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  70.24 
 
 		 213 aa  292  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  71.5 
 
 		 213 aa  292  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  70.53 
 
 		 213 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  70.53 
 
 		 213 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  70.53 
 
 		 213 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  68.27 
 
 		 212 aa  288  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  70.53 
 
 		 213 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  69.76 
 
 		 213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  70.39 
 
 		 213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  68.12 
 
 		 212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  67.96 
 
 		 209 aa  276  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  59.22 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  58.85 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  58.54 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  57 
 
 		 223 aa  227  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  57 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  55.34 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  54.76 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  48.79 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  41.06 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  42.18 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  41.71 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  41.71 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  40.58 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  45.05 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  40.76 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  40.1 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  41.71 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  41.23 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  41.23 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  39.71 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  43.07 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  42 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  38.76 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  33.01 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  33.01 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  35.92 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  31.31 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  35.92 
 
 		 237 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  31.58 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.85 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  30.29 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  30.35 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  35.61 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  28.64 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  32.38 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  33.33 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  32.34 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.37 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  32.84 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  29.86 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  29.86 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  26.47 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  28.37 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  36.45 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  28.22 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  29.7 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  31.1 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  35.33 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  30.95 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.07 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  27.76 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  29.27 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  29.45 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.12 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.49 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  30.35 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  27.67 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.76 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  28.99 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  27.01 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  26.92 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  33.67 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.37 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  28.7 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  30.41 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  27.09 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  27.4 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  27.8 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  30.58 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  28.49 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.49 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  27.42 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.88 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  26.73 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>