275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0696 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  96.32 
 
 
300 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  86.41 
 
 
301 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  60.42 
 
 
302 aa  348  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  60.79 
 
 
302 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  61.09 
 
 
308 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  61.09 
 
 
308 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  59.93 
 
 
298 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  62.55 
 
 
291 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  60.36 
 
 
308 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  60.73 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  60.73 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  60.64 
 
 
308 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  58.16 
 
 
295 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  59.19 
 
 
298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  59.64 
 
 
304 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  57.8 
 
 
299 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  59.56 
 
 
273 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  58.16 
 
 
298 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  57.09 
 
 
299 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  56.04 
 
 
299 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  57.91 
 
 
305 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  56.38 
 
 
299 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  57.09 
 
 
287 aa  318  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  57.69 
 
 
299 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  39.16 
 
 
285 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  42.09 
 
 
297 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  42.09 
 
 
297 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  42.09 
 
 
297 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  42.09 
 
 
297 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  42.09 
 
 
297 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  42.09 
 
 
297 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  39.19 
 
 
278 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  38.85 
 
 
276 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.49 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  37.41 
 
 
277 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  38.13 
 
 
277 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  38.49 
 
 
291 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  37.96 
 
 
285 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  37.77 
 
 
280 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.76 
 
 
284 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  39.58 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  38.1 
 
 
277 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.6 
 
 
283 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.6 
 
 
283 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.6 
 
 
283 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.6 
 
 
283 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.6 
 
 
283 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.6 
 
 
283 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.6 
 
 
283 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  38.25 
 
 
283 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  38.38 
 
 
277 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  39.37 
 
 
335 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.4 
 
 
287 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  37 
 
 
277 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  38.03 
 
 
277 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  36.65 
 
 
306 aa  165  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  37.63 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  35.13 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.86 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  36.5 
 
 
322 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  38.41 
 
 
272 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  39.64 
 
 
264 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  36.82 
 
 
283 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  35.46 
 
 
304 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.65 
 
 
305 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  34.51 
 
 
282 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  34.51 
 
 
282 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  38.32 
 
 
270 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  34.51 
 
 
282 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  37.23 
 
 
281 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.07 
 
 
321 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  38.69 
 
 
264 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  37.01 
 
 
327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  37.01 
 
 
327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  37.24 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  37.01 
 
 
327 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  35.29 
 
 
307 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  34.59 
 
 
301 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  35.33 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  33.85 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  36.27 
 
 
301 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  35.97 
 
 
301 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  35.04 
 
 
267 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  35.71 
 
 
296 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.65 
 
 
304 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  35.09 
 
 
295 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  35.32 
 
 
282 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  36.01 
 
 
315 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  36.9 
 
 
315 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  34.93 
 
 
290 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  33.92 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  35.77 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  34.78 
 
 
309 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  34.06 
 
 
289 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  37.01 
 
 
307 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  39.16 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  36.55 
 
 
315 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  35.94 
 
 
306 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  36.55 
 
 
315 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>